RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 C12orf40Q86WS4 652 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 MINDY1Q8N5J2 469 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 OR2T33Q8NG76 320 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ITFG2Q969R8 447 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 MRGPRX2Q96LB1 330 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 CD93Q9NPY3 652 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 TAS2R9Q9NYW1 312 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 GLTPD2A6NH11 291 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM72CH0Y354 149 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM72AQ5TYM5 149 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM72DQ6L9T8 149 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 CEACAM19Q7Z692 300 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM72BQ86X60 149 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 MOCOSQ96EN8 888 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 BCKDHAP12694 445 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 HACD2Q6Y1H2 254 aa23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 FBP2O00757 339 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC35E2BP0CK96 405 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 PET100P0DJ07 73 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 AGXTP21549 392 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC35G1Q2M3R5 365 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC39A1Q9NY26 324 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 SARDHQ9UL12 918 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 GKN3PP0CG01 181 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 TYRP14679 529 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 CASRP41180 1078 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 GATAD2BQ8WXI9 593 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNN1Q92952 543 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 MAFFQ9ULX9 164 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 TESCQ96BS2 214 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 BORCS6Q96GS4 357 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa23.23■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 GDI1P31150 447 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM69Q5SWH9 247 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 RASGRP3Q8IV61 690 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 LMO3Q8TAP4 145 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 OTUB2Q96DC9 234 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIB3Q96RU7 358 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 CMKLR1Q99788 373 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM246Q9BRR3 403 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 SMOXQ9NWM0 555 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 BPNT1O95861 308 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ABRAXAS2Q15018 415 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGAP40Q5TG30 622 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 NRROSQ86YC3 692 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 OR6N1Q8NGY5 312 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXL12Q9NXK8 326 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 STUB1Q9UNE7 303 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 BEST1O76090 585 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 C7orf61Q8IZ16 206 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 NELL2Q99435 816 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 MAGIXQ9H6Y5 334 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 WNT6Q9Y6F9 365 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 PLD2O14939 933 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 RBBP9O75884 186 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 STSP08842 583 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 H2AFB2P0C5Z0 115 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 UGT2B10P36537 528 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 FLYWCH1Q4VC44 716 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 DTX3Q8N9I9 347 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDH17O14917 1159 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 AXIN1O15169 862 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC16A5O15375 505 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 RFC2P35250 354 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 RBMXP38159 391 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 HK3P52790 923 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 CRISP1P54107 249 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 TSTD1Q8NFU3 115 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 MGLLQ99685 303 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 METTL7AQ9H8H3 244 aa23.22■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 SH3PXD2BA1X283 911 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 HYKKA2RU49 373 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 SPARCP09486 303 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ACRV1P26436 265 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 OR4D2P58180 307 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 NPRL3Q12980 569 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 FADDQ13158 208 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 ARSKQ6UWY0 536 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa23.21■■□□□ 1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC116Q8IYX3 515 aa23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms