RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298231.5

PHOX2A-201, Transcript of paired like homeobox 2A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PHOX2A, Length 1,699 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2A-201ENST00000298231 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa25.13■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 A4GALTQ9NPC4 353 aa25.13■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 TMEM9Q9P0T7 183 aa25.13■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 MOSPD1Q9UJG1 213 aa25.13■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 FBXL21Q9UKT6 434 aa25.13■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 ACSL6Q9UKU0 697 aa25.13■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa25.12■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 TMEM221A6NGB7 291 aa25.12■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 A8MVJ9 347 aa25.12■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 TMEM229AB2RXF0 380 aa25.12■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 M0R296 226 aa25.12■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 SLC5A2P31639 672 aa25.12■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 TSFMP43897 325 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 DAPP51397 102 aa25.12■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 PPP2CBP62714 309 aa25.12■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 PPP2CAP67775 309 aa25.12■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 TUBA3CQ13748 450 aa25.12■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 OR4C11Q6IEV9 310 aa25.12■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 KCTD8Q6ZWB6 473 aa25.12■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 ARMC8Q8IUR7 673 aa25.12■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 TAMM41Q96BW9 452 aa25.12■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 APOL4Q9BPW4 351 aa25.12■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 CXorf36Q9H7Y0 433 aa25.12■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 GUCY1B2O75343 617 aa25.11■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 DNAJB5O75953 348 aa25.11■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 CMPK1P30085 196 aa25.11■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 UBE3DQ7Z6J8 389 aa25.11■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 PDXPQ96GD0 296 aa25.11■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 PITX2Q99697 317 aa25.11■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 OR6C2Q9NZP2 312 aa25.11■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa25.11■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa25.11■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 LRIT2A6NDA9 550 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 RTCAO00442 366 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 TRMUO75648 421 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 APBB3O95704 486 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 ACADMP11310 421 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 AQP1P29972 269 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 SSR2P43308 183 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 CXCR4P61073 352 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 OR2L3Q8NG85 312 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 WDR92Q96MX6 357 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 SLC6A17Q9H1V8 727 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 ADNPQ9H2P0 1102 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 XKR8Q9H6D3 395 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 RUBCNLQ9H714 662 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 SLC6A20Q9NP91 592 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 KRT84Q9NSB2 600 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 PIAS3Q9Y6X2 628 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 KRBA1A5PL33 1030 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 TNFRSF10CO14798 259 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 SLC31A1O15431 190 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 TMPRSS11DO60235 418 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 DCKP27707 260 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 MANFP55145 182 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 EOGTQ5NDL2 527 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 OR5AK3PQ8NH89 298 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 SPPL2AQ8TCT8 520 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 DOK1Q99704 481 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 NRTNQ99748 197 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 GABARAPL3Q9BY60 117 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 CXorf21Q9HAI6 301 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 FZD3Q9NPG1 666 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 NDUFAF4Q9P032 175 aa25.1■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 OR52A4PA6NMU1 304 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 M0QX08 132 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 TOR1BO14657 336 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 LATO43561 262 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 PDE9AO76083 593 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 IL7RP16871 459 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 HTR1BP28222 390 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 BCL6P41182 706 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 ALDH9A1P49189 494 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 NUP107P57740 925 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 RAB39AQ14964 217 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 ANKRD34AQ69YU3 496 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 REEP3Q6NUK4 255 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 MMP21Q8N119 569 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 SIX5Q8N196 739 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 ATG16L2Q8NAA4 619 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 ISOC1Q96CN7 298 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 RIBC2Q9H4K1 309 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 PRDM8Q9NQV8 689 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 CA14Q9ULX7 337 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 SNX7Q9UNH6 387 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 DOCK9Q9BZ29 2069 aa25.09■■□□□ 1.61
PHOX2A-201ENST00000298231 SLC1A7O00341 560 aa25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms