RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 NECTIN3Q9NQS3 549 aa7.26□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.26□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 IFNKQ9P0W0 207 aa7.26□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 PAK5Q9P286 719 aa7.26□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 ATG4BQ9Y4P1 393 aa7.26□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 SPACA6W5XKT8 324 aa7.26□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa7.26□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM64BA6NI03 449 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 BTNL10A8MVZ5 291 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 B3GALT2O43825 422 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 VAPBO95292 243 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 SAT1P21673 171 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 GDF1P27539 372 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 GSTM2P28161 218 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINB3P29508 390 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF136P52737 540 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 HK2P52789 917 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 CCZ1BP86790 482 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 TGM3Q08188 693 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 NAE1Q13564 534 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 ETFDHQ16134 617 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 MPEG1Q2M385 716 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 AGTRAPQ6RW13 159 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 MYO1HQ8N1T3 1032 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC15A4Q8N697 577 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF441Q8N8Z8 693 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 ABHD11Q8NFV4 315 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 TTLQ8NG68 377 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD7Q92527 254 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1191Q96A73 305 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 CAPZA3Q96KX2 299 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF597Q96LX8 424 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 CHP1Q99653 195 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 TM9SF2Q99805 663 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 AIF1LQ9BQI0 150 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 DOHHQ9BU89 302 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 OR8D2Q9GZM6 311 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLPH3Q9H4A6 298 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 CALHM2Q9HA72 323 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 PARVBQ9HBI1 364 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 TREX1Q9NSU2 369 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 SPRR3Q9UBC9 169 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 CAMK2AQ9UQM7 478 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 DYRK1BQ9Y463 629 aa7.25□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 MPDZO75970 2070 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 COL6A5A8TX70 2615 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 TP53I11O14683 189 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 NRDCO43847 1150 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 CDH16O75309 829 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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PGGT1B-201ENST00000296642 CELA3AP09093 270 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP4B1P13584 511 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 HNF4AP41235 474 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 MASP1P48740 699 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 PTH2RP49190 550 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 CLCN7P51798 805 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB38P57729 211 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB8AP61006 207 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF4P78317 190 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXO1Q12778 655 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 DUSP8Q13202 625 aa7.24□□□□□ -1.25
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PGGT1B-201ENST00000296642 XKR6Q5GH73 641 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 DUPD1Q68J44 220 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 BTLAQ7Z6A9 289 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 LUZP2Q86TE4 346 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 HIPK1Q86Z02 1210 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 SCUBE1Q8IWY4 988 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 LMNTD2Q8IXW0 634 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 SYCE1Q8N0S2 351 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 CA13Q8N1Q1 262 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 TXLNBQ8N3L3 684 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 NAXEQ8NCW5 288 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 NUBPLQ8TB37 319 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC35B2Q8TB61 432 aa7.24□□□□□ -1.25
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