RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
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CSNK1G2-201ENST00000255641 GCNT6Q5T4J0 391 aa20.27■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR5H6Q8NGV6 325 aa20.27■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 PIP5K1AQ99755 562 aa20.27■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 SH2B3Q9UQQ2 575 aa20.27■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRAPPC4Q9Y296 219 aa20.27■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 A0A075B6Q4 140 aa20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 SEMA7AO75326 666 aa20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 YES1P07947 543 aa20.26■□□□□ 0.83
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CSNK1G2-201ENST00000255641 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 P2RX3P56373 397 aa20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 CDK6Q00534 326 aa20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 SCN1BQ07699 218 aa20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 LAS2Q8IYD9 372 aa20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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CSNK1G2-201ENST00000255641 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa20.26■□□□□ 0.83
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CSNK1G2-201ENST00000255641 ZAR1LA6NP61 321 aa20.26■□□□□ 0.83
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CSNK1G2-201ENST00000255641 MSL3P1P0C860 447 aa20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 PTSQ03393 145 aa20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 GGTA1PQ4G0N0 100 aa20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 SIMC1Q8NDZ2 872 aa20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 WDR48Q8TAF3 677 aa20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 CD79BP40259 229 aa20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 XCR1P46094 333 aa20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.835e-10■■■□□ 18.8
CSNK1G2-201ENST00000255641 P2RY14Q15391 338 aa20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 FUT10Q6P4F1 479 aa20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 B3GLCTQ6Y288 498 aa20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 CPA6Q8N4T0 437 aa20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 FRMD6Q96NE9 622 aa20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC22A4Q9H015 551 aa20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 TVP23BQ9NYZ1 205 aa20.26■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARHGEF33A8MVX0 844 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRPH2P23942 346 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF91Q05481 1191 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 POM121L1PQ3SYA9 428 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 DEFB128Q7Z7B8 93 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ELMOD2Q8IZ81 293 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM9CQ8IZT9 166 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR4M1Q8NGD0 313 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 RAB8BQ92930 207 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 BRD9Q9H8M2 597 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 RNF121Q9H920 327 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 C3orf14Q9HBI5 128 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ACOXLQ9NUZ1 547 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 NLKQ9UBE8 527 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR51B4Q9Y5P0 310 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ALPK3Q96L96 1907 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR10H3O60404 316 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 SCO1O75880 301 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 CRYZL1O95825 349 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 TLE2Q04725 743 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 TATDN3Q17R31 274 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 BTBD16Q32M84 506 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ATAT1Q5SQI0 421 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 BRAT1Q6PJG6 821 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 DEF8Q6ZN54 512 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 PHC2Q8IXK0 858 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 VPS37AQ8NEZ2 397 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ENKURQ8TC29 256 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 TSSK6Q9BXA6 273 aa20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 PTGER1P34995 402 aa20.24■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 RPS25P62851 125 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 CEACAM20Q6UY09 585 aa20.24■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC149Q6ZUS6 474 aa20.24■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 USP30Q70CQ3 517 aa20.24■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMPRSS11BQ86T26 416 aa20.24■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR7G3Q8NG95 312 aa20.24■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 UCK2Q9BZX2 261 aa20.24■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 RACGAP1Q9H0H5 632 aa20.24■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 C5AR2Q9P296 337 aa20.24■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR6C75A6NL08 312 aa20.24■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa20.24■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 SYN3O14994 580 aa20.24■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 TAF12Q16514 161 aa20.24■□□□□ 0.83
CSNK1G2-201ENST00000255641 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa20.24■□□□□ 0.83
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