RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000033158.5

Ubfd1-201, Transcript of Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubfd1, Length 4,849 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 NrmQ8VC65 262 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Olfr315Q8VFG7 309 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 As3mtQ91WU5 376 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Sntg1Q925E1 517 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Pcbd2Q9CZL5 136 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Hspb11Q9D6H2 143 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 CalcrlQ9R1W5 463 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 EvplQ9D952 2035 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Olfr620E9PZ66 313 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Vmn2r48E9Q5D8 855 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 CryaaP24622 196 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 FshrP35378 692 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Tia1P52912 386 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Tmem181aQ3U3W2 474 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Diras2Q5PR73 199 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Lcn3Q62471 182 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 N6amt1Q6SKR2 214 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Mppe1Q80XL7 396 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Sgpp2Q810K3 354 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Fjx1Q8BQB4 450 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Gpr61Q8C010 449 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Mchr1Q8JZL2 353 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 FcrlaQ920A9 352 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Pcyt2Q922E4 404 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Pole4Q9CQ36 118 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Rcan2Q9JHG2 197 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Pld3O35405 488 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 P01652 108 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Sec24aQ3U2P1 1090 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Cpa6Q5U901 438 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Znf182Q6P560 627 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Syt16Q7TN83 639 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Pgm2Q7TSV4 620 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Sidt2Q8CIF6 832 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 EedQ921E6 441 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 ClpxQ9JHS4 634 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Adam28Q9JLN6 793 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Olfr560A0A1B0GSU5 314 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4930455H04RikD3Z622 58 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Cldn2O88552 230 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Mup3P04939 184 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Psmd3P14685 530 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Tcf3P15806 651 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 TrhrP21761 393 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Six5P70178 719 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Znf410Q8BKX7 478 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Rpl4Q9D8E6 419 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Akr1e2Q9DCT1 301 aa16■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Gm13276A0A087WR18 182 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Olfr891E9Q843 316 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Olfr519K7N645 319 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Brd7O88665 651 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Rpl6P47911 296 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Adamts1P97857 968 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 E330014E10RikQ3UL33 481 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 D5Ertd577eQ499F0 481 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Ssr4Q62186 172 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Sall4Q8BX22 1067 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 MastlQ8C0P0 865 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Sirt3Q8R104 334 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Slco3a1Q8R3L5 710 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Olfr103Q920Y8 313 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Ranbp3Q9CT10 491 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 GmfgQ9ERL7 142 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 TescQ9JKL5 214 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Slc7a7Q9Z1K8 510 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Enthd1E9Q1Z2 618 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Scarb2O35114 478 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Wnt8aQ64527 354 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Olfr594Q7TRR4 311 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Batf2Q8R1H8 277 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Vmn1r22Q8R2D1 302 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Vmn1r38Q8R2E1 302 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Ms4a10Q99N03 267 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Znf207Q9JMD0 495 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Smok4aA0JLX3 433 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Vmn2r90E9PXJ8 863 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Itga10E9Q6R1 1167 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 9130023H24RikQ8BG98 337 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Shc2Q8BMC3 573 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Abhd11Q8K4F5 307 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Zcchc9Q8R1J3 271 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 GmfbQ9CQI3 142 aa15.99■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Gm21800J3QMJ9 180 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 5730507C01RikJ3QPX0 416 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Ctla2aP12399 137 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 AcadvlP50544 656 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Bop1P97452 732 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Glycam1Q02596 151 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Clec4a4Q5YIR8 236 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 FRRS1Q8K385 592 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Gtpbp3Q923K4 492 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 RragcQ99K70 398 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Q9CZV2 255 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Eif3kQ9DBZ5 218 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Rsc1a1Q9ER99 582 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Vmn2r42O35192 852 aa15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Ido1P28776 407 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Ubfd1-201ENSMUST00000033158 Cep76Q0VEJ0 659 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.4 ms