RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620394.1

SRRT-218, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-218ENST00000620394 HSD17B7P56937 341 aa20.56■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 RAB10P61026 200 aa20.56■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 C2orf54Q08AI8 447 aa20.56■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa20.56■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 EFCAB11Q9BUY7 163 aa20.56■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 A0A0G2JN53 185 aa20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 ANKDD1BA6NHY2 528 aa20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 NPIPA5E9PKD4 350 aa20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 E9PLN8 166 aa20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 CLGNO14967 610 aa20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 B3GALT2O43825 422 aa20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 HLCSP50747 726 aa20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 PDK4Q16654 411 aa20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 ADNP2Q6IQ32 1131 aa20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 TRIM40Q6P9F5 258 aa20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 ABHD17CQ6PCB6 329 aa20.55■□□□□ 0.88
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SRRT-218ENST00000620394 ZNF595Q8IYB9 648 aa20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 GHDCQ8N2G8 530 aa20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 TMEM52Q8NDY8 209 aa20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 AGAP11Q8TF27 550 aa20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 CCT6BQ92526 530 aa20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 SERINC2Q96SA4 455 aa20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 VKORC1Q9BQB6 163 aa20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 DEFB126Q9BYW3 111 aa20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 NPIPA1Q9UND3 350 aa20.55■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 FCHO1O14526 889 aa20.54■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 MYO1DO94832 1006 aa20.54■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 TFEBP19484 476 aa20.54■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 SPRP35270 261 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 CLCN2P51788 898 aa20.54■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 GPR143P51810 404 aa20.54■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 CAV1Q03135 178 aa20.54■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 DOC2AQ14183 400 aa20.54■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 TBCCQ15814 346 aa20.54■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa20.54■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 FBXO48Q5FWF7 155 aa20.54■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 GRTP1Q5TC63 336 aa20.54■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 ESAMQ96AP7 390 aa20.54■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 VMP1Q96GC9 406 aa20.54■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 ADAP2Q9NPF8 381 aa20.54■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 CD274Q9NZQ7 290 aa20.54■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 DAPP1Q9UN19 280 aa20.54■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 ASB1Q9Y576 335 aa20.54■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa20.53■□□□□ 0.88
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SRRT-218ENST00000620394 ASNA1O43681 348 aa20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 SLC35E2BP0CK96 405 aa20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 ZNF24P17028 368 aa20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 CERS1P27544 350 aa20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 CASP2P42575 452 aa20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 PLA2G16P53816 162 aa20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 MTTPP55157 894 aa20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 PCDH1Q08174 1060 aa20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 NAB1Q13506 487 aa20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 LAPTM5Q13571 262 aa20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 MAPKAPK3Q16644 382 aa20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 XKR6Q5GH73 641 aa20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 PAGE2BQ5JRK9 111 aa20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 SNX31Q8N9S9 440 aa20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 FBXO25Q8TCJ0 367 aa20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 UBTD2Q8WUN7 234 aa20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 SDCCAG3Q96C92 435 aa20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 DMRTA2Q96SC8 542 aa20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 CSF3RQ99062 836 aa20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 RAB17Q9H0T7 212 aa20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 COQ3Q9NZJ6 369 aa20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 NUDT4Q9NZJ9 180 aa20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 RNF112Q9ULX5 631 aa20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 PRRG2O14669 202 aa20.52■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 DIAPH2O60879 1101 aa20.52■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 PPP2R1BP30154 601 aa20.52■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 STX2P32856 288 aa20.52■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 KCNC1P48547 511 aa20.52■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 PLTPP55058 493 aa20.52■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 LIM2P55344 173 aa20.52■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 RNFT1Q5M7Z0 435 aa20.52■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 ZDHHC24Q6UX98 284 aa20.52■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 ISCA2Q86U28 154 aa20.52■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 CTAGE3PQ8IX95 158 aa20.52■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 FAM47BQ8NA70 645 aa20.52■□□□□ 0.88
SRRT-218ENST00000620394 POGLUT1Q8NBL1 392 aa20.52■□□□□ 0.88
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