RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 ATG10Q9H0Y0 220 aa20.54■□□□□ 0.88
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SGMS1-210ENST00000619438 H0YIV9 168 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 SMIM18P0DKX4 95 aa20.54■□□□□ 0.88
SGMS1-210ENST00000619438 SDC1P18827 310 aa20.54■□□□□ 0.88
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SGMS1-210ENST00000619438 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.54■□□□□ 0.88
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SGMS1-210ENST00000619438 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
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SGMS1-210ENST00000619438 OR4K3Q96R72 315 aa20.51■□□□□ 0.87
SGMS1-210ENST00000619438 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SGMS1-210ENST00000619438 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SGMS1-210ENST00000619438 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SGMS1-210ENST00000619438 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SGMS1-210ENST00000619438 VPS29Q9UBQ0 182 aa20.51■□□□□ 0.87
SGMS1-210ENST00000619438 KRT87PA6NCN2 255 aa20.5■□□□□ 0.87
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