RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614059.4

RPS6KC1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPS6KC1, Length 4,188 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1-208ENST00000614059 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 CNR2P34972 360 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 HTR2BP41595 481 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 MAGEA2P43356 314 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 DNASE1L1P49184 302 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 DOC2AQ14183 400 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 KLHL24Q6TFL4 600 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF534Q76KX8 674 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF627Q7L945 461 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 KREMEN2Q8NCW0 462 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 ERVK-11Q9UQG0 969 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 KCNK6Q9Y257 313 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 A0A0X1KG70 313 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 PRODHO43272 600 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 TSPAN6O43657 245 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 EDNRAP25101 427 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 ACVR2AP27037 513 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 GRK6P43250 576 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 PRKCZQ05513 592 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 MNTQ99583 582 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 MMP28Q9H239 520 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 GPR52Q9Y2T5 361 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 DOT1LQ8TEK3 1739 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 A0A0G2JPF8 293 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 NDUFS4O43181 175 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 ENTPD6O75354 484 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 CD2P06729 351 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 ZNF24P17028 368 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 GABRB3P28472 473 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 CCR8P51685 355 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 SCAPQ12770 1279 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 GPR17Q13304 367 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 SPCS2Q15005 226 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 ASB12Q8WXK4 309 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 KCNK12Q9HB15 430 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 GPRC5BQ9NZH0 403 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 FNIP2Q9P278 1114 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 C5AR2Q9P296 337 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 KNTC1P50748 2209 aa13.43□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 A0A1B0GVT2 93 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 CD8B2A6NJW9 211 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 OR12D1P0DN82 309 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 CD8BP10966 210 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 CBLP22681 906 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 ACTR1BP42025 376 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC11A1P49279 550 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 ACTR1AP61163 376 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 GRIK2Q13002 908 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 RGMAQ96B86 450 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 SLC25A36Q96CQ1 311 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 APIPQ96GX9 242 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 NDC1Q9BTX1 674 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 GPR62Q9BZJ7 368 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 REEP4Q9H6H4 257 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 HPF1Q9NWY4 346 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 FBXL3Q9UKT7 428 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 WNT6Q9Y6F9 365 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 GIMD1P0DJR0 217 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 PCSK2P16519 638 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 CA5AP35218 305 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 ACVR1BP36896 505 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 UPP1Q16831 310 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 FAM214AQ32MH5 1076 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 NHSL2Q5HYW2 709 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 IQCF1Q8N6M8 205 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 DPF3Q92784 378 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 MGME1Q9BQP7 344 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 POPDC3Q9HBV1 291 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 TRIM36Q9NQ86 728 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 CENPMQ9NSP4 180 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 OLAHQ9NV23 265 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 SCGNO76038 276 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 HPRP00739 348 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 IL3P08700 152 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 HLA-EP13747 358 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 PYCR1P32322 319 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 CRISP1P54107 249 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 CLDN8P56748 225 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 ST3GAL3Q11203 375 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 SMCO1Q147U7 214 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 C2orf27AQ580R0 203 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa13.42□□□□□ -0.26
RPS6KC1-208ENST00000614059 VITQ6UXI7 678 aa13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms