RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609454.5

ANKRD54-211, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-211ENST00000609454 ADPRMQ3LIE5 342 aa17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 TMEM35AQ53FP2 167 aa17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 ADNP2Q6IQ32 1131 aa17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 VN1R5Q7Z5H4 357 aa17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 TMEM156Q8N614 296 aa17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 UBTD2Q8WUN7 234 aa17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 ATP6V1E2Q96A05 226 aa17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 CMTM7Q96FZ5 175 aa17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 VMP1Q96GC9 406 aa17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 SCYL1Q96KG9 808 aa17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 QRFPRQ96P65 431 aa17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 NPAS2Q99743 824 aa17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 ACSS3Q9H6R3 686 aa17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 ACTR8Q9H981 624 aa17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 DAPP1Q9UN19 280 aa17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 ASB1Q9Y576 335 aa17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 PRAMEF4O60810 478 aa17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 SLC25A12O75746 678 aa17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 STSP08842 583 aa17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 CD22P20273 847 aa17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 MLF1P58340 268 aa17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 TERF2Q15554 542 aa17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 MDS2Q8NDY4 140 aa17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 REPS1Q96D71 796 aa17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 HES7Q9BYE0 225 aa17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 LYRM4Q9HD34 91 aa17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 ADAP2Q9NPF8 381 aa17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 WIPF3A6NGB9 483 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 SAP18O00422 153 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 CTNSO60931 367 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 KRT38O76015 456 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 ZFAND5O76080 213 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 CPN2P22792 545 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 MST1P26927 711 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 PIK3CGP48736 1102 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 SERPINB9P50453 376 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 TDGF1P3P51864 188 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 SETDB1Q15047 1291 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 LIPJQ5W064 366 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 GRHL2Q6ISB3 625 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 SCUBE1Q8IWY4 988 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 ACOT4Q8N9L9 421 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 C7orf57Q8NEG2 295 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 OR7G3Q8NG95 312 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 NCLNQ969V3 563 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 RGMAQ96B86 450 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 MAGED4Q96JG8 741 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 MS4A8Q9BY19 250 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 PRDM7Q9NQW5 492 aa17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 NPIPA5E9PKD4 350 aa17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 RTCAO00442 366 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 DYRK3O43781 588 aa17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 RBP1P09455 135 aa17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 EPORP19235 508 aa17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 HLCSP50747 726 aa17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 SERTAD2Q14140 314 aa17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTCAP3Q53RY4 240 aa17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 LAS2Q8IYD9 372 aa17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 TMEM52Q8NDY8 209 aa17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 KIF18AQ8NI77 898 aa17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 SCMH1Q96GD3 660 aa17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 CSF3RQ99062 836 aa17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 OR51B5Q9H339 312 aa17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 NPIPA1Q9UND3 350 aa17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 ERVK-11Q9UQG0 969 aa17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 SCN2AQ99250 2005 aa17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 CCL21O00585 134 aa17.9■□□□□ 0.46
ANKRD54-211ENST00000609454 CYR61O00622 381 aa17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms