RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, humanhuman

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4-208ENST00000597315 PYGBP11216 843 aa25.26■■□□□ 1.63
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BRD4-208ENST00000597315 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
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BRD4-208ENST00000597315 GGTA1PQ4G0N0 100 aa25.21■■□□□ 1.63
BRD4-208ENST00000597315 FAM180AQ6UWF9 173 aa25.21■■□□□ 1.63
BRD4-208ENST00000597315 TDRPQ86YL5 185 aa25.21■■□□□ 1.63
BRD4-208ENST00000597315 CRLF3Q8IUI8 442 aa25.21■■□□□ 1.63
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