RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC5A11Q8WWX8 675 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 OR52A5Q9H2C5 316 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 COQ6Q9Y2Z9 468 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRK1Q38SD2 2015 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 TRABD2BA6NFA1 517 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 SDC3O75056 442 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 RFPL3O75679 317 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 SERPINA1P01009 418 aa24.29■■□□□ 1.48
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 IL18R1Q13478 541 aa24.29■■□□□ 1.48
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CAPNS1-204ENST00000587718 C11orf96Q7Z7L8 435 aa24.29■■□□□ 1.48
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CAPNS1-204ENST00000587718 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa24.29■■□□□ 1.48
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CAPNS1-204ENST00000587718 PCBD2Q9H0N5 130 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 DMRT3Q9NQL9 472 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 SPATA7Q9P0W8 599 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 V9GYQ6 96 aa24.29■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 LRATO95237 230 aa24.28■■□□□ 1.48
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CAPNS1-204ENST00000587718 IDSP22304 550 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF763Q0D2J5 394 aa24.28■■□□□ 1.48
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CAPNS1-204ENST00000587718 TMPRSS11BQ86T26 416 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKRD46Q86W74 232 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.488e-53■■■□□ 14.8
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CAPNS1-204ENST00000587718 CEPT1Q9Y6K0 416 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 ENO4A6NNW6 628 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 K7ESM1 405 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 GNGT2O14610 69 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 OR6B1O95007 311 aa24.27■■□□□ 1.48
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CAPNS1-204ENST00000587718 PCNAP12004 261 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 SOX11P35716 441 aa24.27■■□□□ 1.48
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CAPNS1-204ENST00000587718 FAM86B1Q8N7N1 296 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 REEP4Q9H6H4 257 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 PELI2Q9HAT8 420 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 MYNNQ9NPC7 610 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 UCKL1Q9NWZ5 548 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 C3orf18Q9UK00 162 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 VPS4AQ9UN37 437 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-204ENST00000587718 PIPSLA2A3N6 862 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 POM121BA6NF01 834 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDH7O60245 1069 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 GSNP06396 782 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 DDX5P17844 614 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
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CAPNS1-204ENST00000587718 PNCKQ6P2M8 343 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 Q6ZSR6 202 aa24.26■■□□□ 1.47
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CAPNS1-204ENST00000587718 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRTM4Q86VH4 590 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 AMZ2Q86W34 360 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 KRT78Q8N1N4 520 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 METTL4Q8N3J2 472 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 ASB12Q8WXK4 309 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 TUBA1CQ9BQE3 449 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 NT5DC2Q9H857 520 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 IL1RAPQ9NPH3 570 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 DSPP15924 2871 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 C1orf226A1L170 272 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 KRT87PA6NCN2 255 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 GABRR3A8MPY1 467 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 SIGLEC6O43699 453 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 SEMA3DO95025 777 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 MT-ND1P03886 318 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 SEMG1P04279 462 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 LAMP1P11279 417 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 CXCR2P25025 360 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 KDELR2P33947 212 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-204ENST00000587718 DCTP40126 519 aa24.25■■□□□ 1.47
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