RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586027.5

GIPC1-205, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-205ENST00000586027 Q6ZSR9 355 aa29.61■■■□□ 2.33
GIPC1-205ENST00000586027 DYDC1Q8WWB3 177 aa29.61■■■□□ 2.33
GIPC1-205ENST00000586027 TBC1D20Q96BZ9 403 aa29.61■■■□□ 2.33
GIPC1-205ENST00000586027 MESP1Q9BRJ9 268 aa29.61■■■□□ 2.33
GIPC1-205ENST00000586027 NMRK1Q9NWW6 199 aa29.61■■■□□ 2.33
GIPC1-205ENST00000586027 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
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GIPC1-205ENST00000586027 FHP07954 510 aa29.6■■■□□ 2.33
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GIPC1-205ENST00000586027 FAM47BQ8NA70 645 aa29.59■■■□□ 2.33
GIPC1-205ENST00000586027 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa29.59■■■□□ 2.33
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GIPC1-205ENST00000586027 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
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GIPC1-205ENST00000586027 FBXW2Q9UKT8 454 aa29.59■■■□□ 2.33
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GIPC1-205ENST00000586027 LOC400499M0QZD8 3231 aa29.58■■■□□ 2.33
GIPC1-205ENST00000586027 PKD1L2Q7Z442 2459 aa29.57■■■□□ 2.32
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GIPC1-205ENST00000586027 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-205ENST00000586027 LSM1O15116 133 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-205ENST00000586027 ATP6AP2O75787 350 aa29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-205ENST00000586027 CPN2P22792 545 aa29.54■■■□□ 2.32
GIPC1-205ENST00000586027 VAC14Q08AM6 782 aa29.54■■■□□ 2.32
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