RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 TPSB2P20231 275 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 CCNOP22674 350 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 UQCRC2P22695 453 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 GATA3P23771 443 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 HRH2P25021 359 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 CHATP28329 748 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 HOXA6P31267 233 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 DCTDP32321 178 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 RPL21P46778 160 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 CCR4P51679 360 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 RAD23BP54727 409 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 TSPAN5P62079 268 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 HERV-K104P63124 156 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 TNNC1P63316 161 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 FKBP1BP68106 108 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 CYP4F2P78329 520 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 BDH1Q02338 343 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 OCA2Q04671 838 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 PJVKQ0ZLH3 352 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 GAGE2BQ13066 116 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 UBE2V1Q13404 147 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 VEZF1Q14119 521 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 RCAN2Q14206 197 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 HERC3Q15034 1050 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 TPSAB1Q15661 275 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 NPTX1Q15818 432 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 RNF151Q2KHN1 245 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 GAGE2EQ4V326 116 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 METRNLQ641Q3 311 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 PYHIN1Q6K0P9 492 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 GAGE2AQ6NT46 116 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 ARMC6Q6NXE6 501 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 SLC39A4Q6P5W5 647 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 VRK2Q86Y07 508 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 SYT12Q8IV01 421 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 FAM114A1Q8IWE2 563 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 SPATA6LQ8N4H0 392 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 EMC1Q8N766 993 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 SYT14Q8NB59 555 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 CDC26Q8NHZ8 85 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 RFT1Q96AA3 541 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 FKBP10Q96AY3 582 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 PYCR2Q96C36 320 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 FAM20AQ96MK3 541 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 FOXN4Q96NZ1 517 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 DUX5Q96PT3 197 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 ALS2CR12Q96Q35 445 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 CCT8L2Q96SF2 557 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 KRT12Q99456 494 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 TMEM175Q9BSA9 504 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 LRRC2Q9BYS8 371 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 ZMYND12Q9H0C1 365 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 ELOVL3Q9HB03 270 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 CD320Q9NPF0 282 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 NRBP2Q9NSY0 501 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 TXLNGQ9NUQ3 528 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 HIF1ANQ9NWT6 349 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 MIS18AQ9NYP9 233 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 KLHL13Q9P2N7 655 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 P2RX2Q9UBL9 471 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 ACSL5Q9ULC5 683 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 SATB2Q9UPW6 733 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 ERVK-19Q9WJR5 959 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 ATG4BQ9Y4P1 393 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 LRP12Q9Y561 859 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 NPTNQ9Y639 398 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 EVC2Q86UK5 1308 aa3.3□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 TRGV11A0A075B6L2 103 aa3.3□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 TMEM200CA6NKL6 621 aa3.3□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 TRPC5OSA6NMA1 111 aa3.3□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 A8MU76 341 aa3.3□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 A8MXQ7 604 aa3.3□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 DIRC3C9JPN6 131 aa3.3□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 F8VVB4 439 aa3.3□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 F8VWA3 439 aa3.3□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 NPIPA3F8WFD2 350 aa3.3□□□□□ -1.88
CS-232ENST00000552331 CLIC1O00299 241 aa3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms