RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551253.5

CS-225, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 676 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-225ENST00000551253 LINC01387J3KSC0 135 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 ACSL3O95573 720 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 SLC16A8O95907 504 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 SYF2O95926 243 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 ALBP02768 609 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 CTSBP07858 339 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 ABHD2P08910 425 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 CD46P15529 392 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 STMN1P16949 149 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 HIST1H2ADP20671 130 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 SAT1P21673 171 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 ACVR2AP27037 513 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 IMPA1P29218 277 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 ADH7P40394 386 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 PGGT1BP53609 377 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 PNLIPRP1P54315 467 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 ARSFP54793 590 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 SLC12A2P55011 1212 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 AP1S2P56377 157 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 RAB10P61026 200 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 ZNF460Q14592 562 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 USP10Q14694 798 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 NAA25Q14CX7 972 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 ETFDHQ16134 617 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 SBSNQ6UWP8 590 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 OVCH1Q7RTY7 1134 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 AMER3Q8N944 861 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 TMEM178AQ8NBL3 297 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 MDS2Q8NDY4 140 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 OR2L3Q8NG85 312 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 OR2A1Q8NGT9 310 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 ZNF480Q8WV37 535 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 SMPDL3AQ92484 453 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 ZUFSPQ96AP4 578 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 DACH2Q96NX9 599 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 ZNF747Q9BV97 191 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 HES7Q9BYE0 225 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 DERL2Q9GZP9 239 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 SLC26A1Q9H2B4 701 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 PARVBQ9HBI1 364 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 SLC22A11Q9NSA0 550 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 EURLQ9NYK6 297 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 TARM1B6A8C7 271 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 DSCR3O14972 297 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 RIPK2O43353 540 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 LMX1BO60663 402 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 PRMT3O60678 531 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 CCNDBP1O95273 360 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 SLU7O95391 586 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 INHBAP08476 426 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 CD1DP15813 335 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 ITGAXP20702 1163 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 MAGP20916 626 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 ALAS2P22557 587 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 PSMB5P28074 263 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 CMPK1P30085 196 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 IDUAP35475 653 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 GRIA3P42263 894 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 SERPINB9P50453 376 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 CASP9P55211 416 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 CDKL1Q00532 357 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 SORDQ00796 357 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 ZNF33BQ06732 778 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 NKG7Q16617 165 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-225ENST00000551253 PHKG1Q16816 387 aa6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms