RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530170.1

RPS3-215, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 5

Gene RPS3, Length 531 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-215ENST00000530170 RACGAP1Q9H0H5 632 aa8.76□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 HMG20AQ9NP66 347 aa8.76□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.76□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 GPATCH2Q9NW75 528 aa8.76□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.76□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 TAS2R7Q9NYW3 318 aa8.76□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 EHD3Q9NZN3 535 aa8.76□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 NDUFAF4Q9P032 175 aa8.76□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 OR2A25A4D2G3 310 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 SH3D21A4FU49 640 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 B4GAT1O43505 415 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 ADAP00813 363 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 PIPP12273 146 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 EPCAMP16422 314 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 RHCEP18577 417 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 DDCP20711 480 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 AGXTP21549 392 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 PDHA2P29803 388 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 CD6P30203 668 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 KRT20P35900 424 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 UGT2B10P36537 528 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 MASP1P48740 699 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 C21orf59P57076 290 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 TUBA1BP68363 451 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 HBA1P69905 142 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 CDK6Q00534 326 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 ADAM15Q13444 863 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 ZNF846Q147U1 533 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 CRTC3Q6UUV7 619 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 TMEM64Q6YI46 380 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 TUBA1AQ71U36 451 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 VTCN1Q7Z7D3 282 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 LRRTM4Q86VH4 590 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 P2RY8Q86VZ1 359 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 C17orf64Q86WR6 236 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 C12orf40Q86WS4 652 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 OR10G2Q8NGC3 310 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 OR4K1Q8NGD4 311 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 OR5K2Q8NHB8 316 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 MIPOL1Q8TD10 442 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 CXorf40AQ8TE69 158 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 SMPDL3AQ92484 453 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 TAMM41Q96BW9 452 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 FAM129BQ96TA1 746 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 TIMM29Q9BSF4 260 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 MENTQ9BUN1 341 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 SARGQ9BW04 601 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 RIBC2Q9H4K1 309 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 RMI1Q9H9A7 625 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 FBRSQ9HAH7 460 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 ACOT13Q9NPJ3 140 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 AKIP1Q9NQ31 210 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 DYRK4Q9NR20 520 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 DZANK1Q9NVP4 752 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 GALNT8Q9NY28 637 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 GDE1Q9NZC3 331 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 DEC1Q9P2X7 70 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 ACSL5Q9ULC5 683 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 ENPP4Q9Y6X5 453 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 DSPPQ9NZW4 1301 aa8.75□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 NINQ8N4C6 2090 aa8.74□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 ZNF292O60281 2723 aa8.74□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 PRR19A6NJB7 356 aa8.74□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 CLDN25C9JDP6 229 aa8.74□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 hCG_2039718K7EN88 272 aa8.74□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 TNFRSF11BO00300 401 aa8.74□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 MITFO75030 526 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 WBP4O75554 376 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 POP7O75817 140 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 KLHL18O94889 574 aa8.74□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 C6orf47O95873 294 aa8.74□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 MT-ND2P03891 347 aa8.74□□□□□ -1.01
RPS3-215ENST00000530170 CD46P15529 392 aa8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.2 ms