RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520687.1

SPARC-202, Transcript of secreted protein acidic and cysteine rich, humanhuman

TSL 2

Gene SPARC, Length 1,598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARC-202ENST00000520687 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 FBXL20Q96IG2 436 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 HSH2DQ96JZ2 352 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 MUS81Q96NY9 551 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 IL17FQ96PD4 163 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 APOL4Q9BPW4 351 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 C1GALT1Q9NS00 363 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 THSD1Q9NS62 852 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 OR6C2Q9NZP2 312 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ENOPH1Q9UHY7 261 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ERVK-11Q9UQG0 969 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 PRKAB1Q9Y478 270 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 OR1A2Q9Y585 309 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 CEPT1Q9Y6K0 416 aa9.5□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 CKAP5Q14008 2032 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 LRRK1Q38SD2 2015 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 MAST4O15021 2626 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 TBC1D3EA0A087X179 549 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 DCDC2BA2VCK2 349 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 CCDC160A6NGH7 325 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 TBC1D3LB9A6J9 549 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 PLPP1O14494 284 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 NDUFS4O43181 175 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 HS6ST1O60243 411 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 PDE9AO76083 593 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 KLHL18O94889 574 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 OR6B1O95007 311 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 C6orf47O95873 294 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 IL3P08700 152 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 CCDC159P0C7I6 412 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 TBC1D3HP0C7X1 549 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ARAFP10398 606 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 IGFBP5P24593 272 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 HTR1BP28222 390 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 CMPK1P30085 196 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 SHMT2P34897 504 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 FRKP42685 505 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 CRATP43155 626 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 MVDP53602 400 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 YPEL5P62699 121 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 CSNK1G2P78368 415 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 KCNAB2Q13303 367 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ZIC1Q15915 447 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 IFI44LQ53G44 452 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ZNF385BQ569K4 471 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 EOGTQ5NDL2 527 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 C6orf141Q5SZD1 244 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ZNF691Q5VV52 312 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 KDM4DQ6B0I6 523 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ADNP2Q6IQ32 1131 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ARMC8Q8IUR7 673 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 IL17RCQ8NAC3 791 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 DTWD2Q8NBA8 298 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ZNF740Q8NDX6 193 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 PSMA8Q8TAA3 256 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 FAM81AQ8TBF8 368 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 FBLIM1Q8WUP2 373 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 RASSF5Q8WWW0 418 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ZNF566Q969W8 418 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 TM4SF18Q96CE8 201 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 NEURL3Q96EH8 262 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 SIPA1Q96FS4 1042 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 MPP4Q96JB8 637 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 C7orf34Q96L11 122 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 OR2M4Q96R27 311 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 MBOAT4Q96T53 435 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 SPNS1Q9H2V7 528 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 EPS8L2Q9H6S3 715 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 SMURF2Q9HAU4 748 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 A4GALTQ9NPC4 353 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 SERGEFQ9UGK8 458 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 R4GN57 208 aa9.49□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 A0A1W2PQF6 199 aa9.48□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 TMEM247A6NEH6 219 aa9.48□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 LRRC72A6NJI9 287 aa9.48□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 H7BY64 318 aa9.48□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 M0QX08 132 aa9.48□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 PDPK1O15530 556 aa9.48□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 OR1F1O43749 312 aa9.48□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 B3GALT4O96024 378 aa9.48□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 NTRK1P04629 796 aa9.48□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ACADMP11310 421 aa9.48□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 ANXA8P13928 327 aa9.48□□□□□ -0.89
SPARC-202ENST00000520687 IGFALSP35858 605 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms