RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	OR7G3	Q8NG95	312 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193		H3BSH0	61 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193		M0R129	80 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	UQCRC2	P22695	453 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GDI1	P31150	447 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GRIA2	P42262	883 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GRK6	P43250	576 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF45	Q02386	682 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TUBB3	Q13509	450 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	EIPR1	Q53HC9	387 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GAB3	Q8WWW8	586 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SLC39A13	Q96H72	371 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ACPT	Q9BZG2	426 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	BEX1	Q9HBH7	125 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GMEB1	Q9Y692	573 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SLC16A5	O15375	505 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	FCER2	P06734	321 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	RHO	P08100	348 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	HSD3B1	P14060	373 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ITIH1	P19827	911 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	HSD3B2	P26439	372 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ACADL	P28330	430 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ACSL1	P33121	698 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	DPP6	P42658	865 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	HYAL2	Q12891	473 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CBLB	Q13191	982 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	NDUFA9	Q16795	377 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	DTX3	Q8N9I9	347 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CHST4	Q8NCG5	386 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GTF2H4	Q92759	462 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	RNF38	Q9H0F5	515 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	KLHL31	Q9H511	634 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SCN9A	Q15858	1988 aa		7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	FUOM	A2VDF0	154 aa		7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ARNTL	O00327	626 aa		7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MID1	O15344	667 aa		7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GNRH1	P01148	92 aa		7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ACVR2A	P27037	513 aa		7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CNR2	P34972	360 aa		7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	RUNDC3A	Q59EK9	446 aa		7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	NCSTN	Q92542	709 aa		7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	FRMD6	Q96NE9	622 aa		7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CD180	Q99467	661 aa		7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	OR51I1	Q9H343	314 aa		7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	OLAH	Q9NV23	265 aa		7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MARK1	Q9P0L2	795 aa		7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	FEZF1	A0PJY2	475 aa		7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	KMO	O15229	486 aa		7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	YES1	P07947	543 aa		7.72	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CSF2RA	P15509	400 aa		7.72	□□□□□ -1.17

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