RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511955.5

TRAPPC11-208, Transcript of trafficking protein particle complex 11, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC11, Length 2,342 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11-208ENST00000511955 CASTOR2A6NHX0 329 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 C2orf74A8MZ97 194 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 NPIPA7E9PJI5 369 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 CCDC188H7C350 402 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 B4GALT3O60512 393 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 GPC4O75487 556 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 CFIP05156 583 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
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TRAPPC11-208ENST00000511955 NPIPA8P0DM63 369 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 CXCL8P10145 99 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 IL12BP29460 328 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 CXCR5P32302 372 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 FEN1P39748 380 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 ACTR1BP42025 376 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 MAGEA11P43364 429 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 SLC6A12P48065 614 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 PPP3CCP48454 512 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 TMED10P49755 219 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 RGS4P49798 205 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 PNLIPRP2P54317 469 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 HYAL2Q12891 473 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 ILKQ13418 452 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
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TRAPPC11-208ENST00000511955 ARMCX5Q6P1M9 558 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 MPZL3Q6UWV2 235 aa4.8□□□□□ -1.64
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TRAPPC11-208ENST00000511955 PRSS42Q7Z5A4 293 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 ZNF280BQ86YH2 543 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 OCC1Q8TAD7 63 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 GDPD5Q8WTR4 605 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 CERS2Q96G23 380 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 NUDT11Q96G61 164 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 SLITRK1Q96PX8 696 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 ACCSQ96QU6 501 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 SIGLEC11Q96RL6 698 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 PAAF1Q9BRP4 392 aa4.8□□□□□ -1.64
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TRAPPC11-208ENST00000511955 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 UBQLN3Q9H347 655 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 MEAF6Q9HAF1 191 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 MAGEF1Q9HAY2 307 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 BRD7Q9NPI1 651 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 KLHL1Q9NR64 748 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 OLFML3Q9NRN5 406 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 C19orf12Q9NSK7 152 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 SEMA5BQ9P283 1151 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 TXNDC16Q9P2K2 825 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 UTS2RQ9UKP6 389 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 CDH9Q9ULB4 789 aa4.8□□□□□ -1.64
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TRAPPC11-208ENST00000511955 MYH11P35749 1972 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 A0A1B0GW15 77 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 GAGE10A6NGK3 116 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 EPOPA6NHQ4 379 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 CDRT15L2A8MXV6 281 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 ANKRD66B4E2M5 251 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 H0Y8X5 98 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 H7C4K7 107 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 NRP2O60462 931 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 PRAMEF2O60811 474 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 GLRA3O75311 464 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 VAMP5O95183 116 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
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TRAPPC11-208ENST00000511955 ITGAXP20702 1163 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 DCTDP32321 178 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 SOX18P35713 384 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 GALCP54803 685 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 GTF2BQ00403 316 aa4.8□□□□□ -1.64
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TRAPPC11-208ENST00000511955 RIN1Q13671 783 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 ATP1A4Q13733 1029 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 PCK2Q16822 640 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 CCDC58Q4VC31 144 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 ACTBL2Q562R1 376 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 C6orf136Q5SQH8 315 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 FBXO42Q6P3S6 717 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 ZDHHC24Q6UX98 284 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 LRRC55Q6ZSA7 311 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 GDF7Q7Z4P5 450 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 YAF2Q8IY57 180 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 LILRA2Q8N149 483 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 METTL25Q8N6Q8 603 aa4.8□□□□□ -1.64
TRAPPC11-208ENST00000511955 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
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