RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 TRIM54Q9BYV2 358 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 PNPLA3Q9NST1 481 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 SAMD15Q9P1V8 674 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 C15orf41Q9Y2V0 281 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 LRRC3CA6NJW4 275 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 SGK494L7N484 410 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 MC3RP41968 323 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 LIX1Q8N485 282 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 BBOF1Q8ND07 529 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF721Q8TF20 911 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 TANKQ92844 425 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 SLCO2A1Q92959 643 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 UBE2E3Q969T4 207 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 TBCDQ9BTW9 1192 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 WHRNQ9P202 907 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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PDE4D-210ENST00000503258 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 FAM227AF5H4B4 570 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 P04436 131 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 TPH1P17752 444 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 RPL22P35268 128 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 GMPRP36959 345 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 ADH7P40394 386 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 FOXL2P58012 376 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 FUT7Q11130 342 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 PHKG1Q16816 387 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 SYT16Q17RD7 645 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 SPANXN3Q5MJ09 141 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 SEL1L2Q5TEA6 688 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 TIGD3Q6B0B8 471 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 OR2A2Q6IF42 318 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 SLC30A6Q6NXT4 461 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF549Q6P9A3 640 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
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PDE4D-210ENST00000503258 TSLPQ969D9 159 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 NCLNQ969V3 563 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 PROK2Q9HC23 129 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 SPRR3Q9UBC9 169 aa7.11□□□□□ -1.27
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PDE4D-210ENST00000503258 OARD1Q9Y530 152 aa7.11□□□□□ -1.27
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PDE4D-210ENST00000503258 TO15178 435 aa7.11□□□□□ -1.27
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PDE4D-210ENST00000503258 MTTPP55157 894 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 GUSBP1Q15486 140 aa7.11□□□□□ -1.27
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PDE4D-210ENST00000503258 PPP1R3AQ16821 1122 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 STEAP4Q687X5 459 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 HSDL2Q6YN16 418 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 MYO1HQ8N1T3 1032 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 LRRC39Q96DD0 335 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 SERPINB12Q96P63 405 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 KCMF1Q9P0J7 381 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 HCN3Q9P1Z3 774 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF175Q9Y473 711 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 SDR42E2A6NKP2 422 aa7.1□□□□□ -1.27
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PDE4D-210ENST00000503258 B3GALT2O43825 422 aa7.1□□□□□ -1.27
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PDE4D-210ENST00000503258 FAM45BPQ6NSW5 357 aa7.1□□□□□ -1.27
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PDE4D-210ENST00000503258 PODNL1Q6PEZ8 512 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 CEP128Q6ZU80 1094 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 CYS1Q717R9 158 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 LAS2Q8IYD9 372 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 FAM45AQ8TCE6 357 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 MS4A6EQ96DS6 147 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 FBXL20Q96IG2 436 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4D-210ENST00000503258 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.1□□□□□ -1.27
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