RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa6.91□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 TXNDC16Q9P2K2 825 aa6.91□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF639Q9UID6 485 aa6.91□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 TINAGQ9UJW2 476 aa6.91□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.91□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 MTUS2Q5JR59 1369 aa6.91□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa6.91□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 FITM1A5D6W6 292 aa6.9□□□□□ -1.3
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PDCD4-211ENST00000498367 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 OR10H2O60403 315 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 NKX2-2O95096 273 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
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PDCD4-211ENST00000498367 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
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PDCD4-211ENST00000498367 LIMS1P48059 325 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 PXNP49023 591 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 CXCR4P61073 352 aa6.9□□□□□ -1.3
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PDCD4-211ENST00000498367 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 FAM189A2Q15884 450 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 RBBP7Q16576 425 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 GUK1Q16774 197 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 C5orf47Q569G3 176 aa6.9□□□□□ -1.3
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PDCD4-211ENST00000498367 ZNF618Q5T7W0 954 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 DUPD1Q68J44 220 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.9□□□□□ -1.3
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PDCD4-211ENST00000498367 ERASQ7Z444 233 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 PDPRQ8NCN5 879 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 OR5M1Q8NGP8 315 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.9□□□□□ -1.3
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PDCD4-211ENST00000498367 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 NPAS1Q99742 590 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 PSD2Q9BQI7 771 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 RTP3Q9BQQ7 232 aa6.9□□□□□ -1.3
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PDCD4-211ENST00000498367 TEKT3Q9BXF9 490 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 SRRQ9GZT4 340 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 GANQ9H2C0 597 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 LYRM4Q9HD34 91 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 MYOZ2Q9NPC6 264 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 RNF146Q9NTX7 359 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 PLK2Q9NYY3 685 aa6.9□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.9□□□□□ -1.3
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PDCD4-211ENST00000498367 MEGF11A6BM72 1044 aa6.89□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.89□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 MARCH11A6NNE9 402 aa6.89□□□□□ -1.31
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PDCD4-211ENST00000498367 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.89□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 SGK494L7N484 410 aa6.89□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 M0QYG6 137 aa6.89□□□□□ -1.31
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PDCD4-211ENST00000498367 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP6.89□□□□□ -1.31
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PDCD4-211ENST00000498367 ZWINTO95229 277 aa6.89□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 HEXAP06865 529 aa6.89□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CTSBP07858 339 aa6.89□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 COX5BP10606 129 aa6.89□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 GFAPP14136 432 aa6.89□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CD36P16671 472 aa6.89□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 MSH3P20585 1137 aa6.89□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CXCR5P32302 372 aa6.89□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 GPR12P47775 334 aa6.89□□□□□ -1.31
PDCD4-211ENST00000498367 CDR2Q01850 454 aa6.89□□□□□ -1.31
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