RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494549.1

ACTR1A-206, Transcript of ARP1 actin related protein 1 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene ACTR1A, Length 520 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1A-206ENST00000494549 PDK3Q15120 406 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 ADPRMQ3LIE5 342 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 SFT2D3Q587I9 215 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 C1orf189Q5VU69 101 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 ATG9BQ674R7 924 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 PRMT9Q6P2P2 845 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 EPGNQ6UW88 154 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 TTLL10Q6ZVT0 673 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 PRSS41Q7RTY9 318 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 TCAIMQ8N3R3 496 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 CSNK1A1LQ8N752 337 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 KCT2Q8NC54 265 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 ADCY4Q8NFM4 1077 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 STAG3L4Q8TBR4 150 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 NT5CQ8TCD5 201 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 EXTL1Q92935 676 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 ESAMQ96AP7 390 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 NACC2Q96BF6 587 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 CLIP3Q96DZ5 547 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 MED8Q96G25 268 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 CNDP1Q96KN2 507 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 CATSPER2Q96P56 530 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 SORT1Q99523 831 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 MESP1Q9BRJ9 268 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 NDC1Q9BTX1 674 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 CD244Q9BZW8 370 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 RHBGQ9H310 441 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 ALG9Q9H6U8 611 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 GPRC5BQ9NZH0 403 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 PTTG2Q9NZH5 202 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 NUDT4Q9NZJ9 180 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 EMCNQ9ULC0 261 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 DTNAQ9Y4J8 743 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 SLC22A7Q9Y694 548 aa8.09□□□□□ -1.11
ACTR1A-206ENST00000494549 ARHGAP10A1A4S6 786 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 H0YJX3 145 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 UBXN8O00124 270 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 TXNDC9O14530 226 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 ZNF195O14628 629 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 DNAJB6O75190 326 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 STK16O75716 305 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 NSA2O95478 260 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 TYK2P29597 1187 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 OR1D4P47884 311 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 RPS15P62841 145 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 FOLH1Q04609 750 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 SLC9A5Q14940 896 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 FAM83EQ2M2I3 478 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 FBXO48Q5FWF7 155 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 BORAQ6PGQ7 559 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 UGT2A3Q6UWM9 527 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 LAPTM4BQ86VI4 370 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 EGFL6Q8IUX8 553 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 C10orf107Q8IVU9 208 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 LAS2Q8IYD9 372 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 DEFB107AQ8IZN7 70 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 PQLC1Q8N2U9 271 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 PYDC1Q8WXC3 89 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 TSNARE1Q96NA8 513 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 FAM210AQ96ND0 272 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 MACROD1Q9BQ69 325 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 C17orf62Q9BQA9 187 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 CTSFQ9UBX1 484 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 TUBD1Q9UJT1 453 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 CLDN16Q9Y5I7 305 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 KCNE2Q9Y6J6 123 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 NAV2Q8IVL1 2488 aa8.08□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 PTPN13Q12923 2485 aa8.07□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 CROCCQ5TZA2 2017 aa8.07□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 LRRC14BA6NHZ5 514 aa8.07□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 H0YIG0 161 aa8.07□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 K7EM74 188 aa8.07□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 E2F3O00716 465 aa8.07□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 SOCS6O14544 535 aa8.07□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 TRIM13O60858 407 aa8.07□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 KATNA1O75449 491 aa8.07□□□□□ -1.12
ACTR1A-206ENST00000494549 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.1 ms