RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
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PRPF40A-210ENST00000489741 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa6.03□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa6.03□□□□□ -1.44
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PRPF40A-210ENST00000489741 KRT87PA6NCN2 255 aa6.03□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 B5MCH6 92 aa6.03□□□□□ -1.44
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PRPF40A-210ENST00000489741 MST1LQ2TV78 715 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 VWA2Q5GFL6 755 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 TOR2AQ5JU69 321 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF425Q6IV72 752 aa6.02□□□□□ -1.45
PRPF40A-210ENST00000489741 TTC23LQ6PF05 361 aa6.02□□□□□ -1.45
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