RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-208ENST00000487290 PEX11GQ96HA9 241 aa15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 PRDM9Q9NQV7 894 aa15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 NMRK1Q9NWW6 199 aa15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 CCL27Q9Y4X3 112 aa15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 KCNMB2Q9Y691 235 aa15.61■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 A0A0G2JN53 185 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 ERVH48-1M5A8F1 160 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 RTCAO00442 366 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 AZIN1O14977 448 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 ALOX12BO75342 701 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 JRKO75564 520 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 PRKAR1AP10644 381 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 RAP1GDS1P52306 607 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 EMP2P54851 167 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 OLR1P78380 273 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 ABRAXAS2Q15018 415 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 UGT3A2Q3SY77 523 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 FAM219BQ5XKK7 198 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 GALNT18Q6P9A2 607 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 BORAQ6PGQ7 559 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 KIRREL2Q6UWL6 708 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 ZNF595Q8IYB9 648 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 OR11G2Q8NGC1 345 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 VPS50Q96JG6 964 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 KCNK9Q9NPC2 374 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 MS4A12Q9NXJ0 267 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 AHSPQ9NZD4 102 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 VPS29Q9UBQ0 182 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 MKL2Q9ULH7 1088 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 ASB4Q9Y574 426 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 TIMM22Q9Y584 194 aa15.6■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 EEDO75530 441 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 CEACAM4O75871 244 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 HEXBP07686 556 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 COX6A1P12074 109 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 HSD17B7P56937 341 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 ATP1A4Q13733 1029 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 CHI3L2Q15782 390 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 TBR1Q16650 682 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 PAGE2Q7Z2X7 111 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 COMMD6Q7Z4G1 85 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 KIRREL3Q8IZU9 778 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 CHTF18Q8WVB6 975 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 CSF3RQ99062 836 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 P4HTMQ9NXG6 502 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 PHF11Q9UIL8 331 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 TUBD1Q9UJT1 453 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 SLC12A4Q9UP95 1085 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa15.59■□□□□ 0.09
HCLS1-208ENST00000487290 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 SAP18O00422 153 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 KLF11O14901 512 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 ATP8B1O43520 1251 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 TMPRSS11DO60235 418 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 SNNO75324 88 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 HPP00738 406 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 C8orf89P0DMQ9 161 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 NEFHP12036 1026 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 OTX2P32243 289 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 RRADP55042 308 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 TNFRSF17Q02223 184 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 PCOLCEQ15113 449 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 LINC00303Q3SY05 128 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 SPIN4Q56A73 249 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 XKR7Q5GH72 579 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 DCAF10Q5QP82 559 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 PCSK4Q6UW60 755 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 CLYBLQ8N0X4 340 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 TMEM52Q8NDY8 209 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 C7orf57Q8NEG2 295 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 FAM76AQ8TAV0 307 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 ZBTB9Q96C00 473 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 FCRL1Q96LA6 429 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 SORT1Q99523 831 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 CCT7Q99832 543 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 ZNF700Q9H0M5 742 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 ACBD3Q9H3P7 528 aa15.58■□□□□ 0.08
HCLS1-208ENST00000487290 TUBB1Q9H4B7 451 aa15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms