RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 OR4D1Q15615 310 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 FBXO48Q5FWF7 155 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 GRTP1Q5TC63 336 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 ABHD17CQ6PCB6 329 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 CYS1Q717R9 158 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 SULF2Q8IWU5 870 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 ARMC10Q8N2F6 343 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 C7orf57Q8NEG2 295 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 STAG3L4Q8TBR4 150 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 AGAP11Q8TF27 550 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 ASB15Q8WXK1 588 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 KIAA1191Q96A73 305 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 KCNC2Q96PR1 638 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 HPF1Q9NWY4 346 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 COQ3Q9NZJ6 369 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 DAPP1Q9UN19 280 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 GTF3C1Q12789 2109 aa18.79■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 CTNSO60931 367 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 TFEBP19484 476 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 PTGS2P35354 604 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 MSH2P43246 934 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 CHIT1Q13231 466 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 SERTAD2Q14140 314 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 SLMAPQ14BN4 828 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 ADPRMQ3LIE5 342 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 PAOXQ6QHF9 649 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 CCDC25Q86WR0 208 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 PPM1NQ8N819 430 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 PDPRQ8NCN5 879 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 SPATA4Q8NEY3 305 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 QRFPRQ96P65 431 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 F2RL3Q96RI0 385 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 RAB17Q9H0T7 212 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 NMRAL1Q9HBL8 299 aa18.78■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 FAM159BA6NKW6 160 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 SUPT3HB4E1H0 165 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 E9PLN8 166 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 RAD51CO43502 376 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 SUPT3HO75486 399 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 TUBB4AP04350 444 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 TPOP07202 933 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 PCNAP12004 261 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 PPP2R1BP30154 601 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 STX2P32856 288 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 PTGER1P34995 402 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 RFC3P40938 356 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 PLGLB1Q02325 96 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 C2orf54Q08AI8 447 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 AP5B1Q2VPB7 878 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 RNFT1Q5M7Z0 435 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 HSDL2Q6YN16 418 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 CHSY3Q70JA7 882 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 ZNF227Q86WZ6 799 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 MORN4Q8NDC4 146 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 OR14A16Q8NHC5 309 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 WDR34Q96EX3 536 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 VKORC1Q9BQB6 163 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 TBCDQ9BTW9 1192 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 CD244Q9BZW8 370 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 PHACTR1Q9C0D0 580 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 ALG9Q9H6U8 611 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 LYRM4Q9HD34 91 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 NUDT4Q9NZJ9 180 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 KCMF1Q9P0J7 381 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 PPT2Q9UMR5 302 aa18.77■□□□□ 0.6
ACTB-212ENST00000484841 ACOT7O00154 380 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 HS6ST1O60243 411 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 OR2J2O76002 312 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 SERPINB1P30740 379 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 CASQ1P31415 396 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 PLTPP55058 493 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 GPR85P60893 370 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 TBCCQ15814 346 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 TMEM35AQ53FP2 167 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 MED27Q6P2C8 311 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 DOLPP1Q86YN1 238 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 TMEM52Q8NDY8 209 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 UBXN10Q96LJ8 280 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 PHF12Q96QT6 1004 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 CSF3RQ99062 836 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 CENPKQ9BS16 269 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 OR8D2Q9GZM6 311 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 PRDM7Q9NQW5 492 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 OPTCQ9UBM4 332 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 COPS7AQ9UBW8 275 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 PYCARDQ9ULZ3 195 aa18.76■□□□□ 0.59
ACTB-212ENST00000484841 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa18.76■□□□□ 0.59
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