RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483639.1

UBE2Q1-205, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 694 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZNF24P17028 368 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 ELK3P41970 407 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 AP1S2P56377 157 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 MLF1P58340 268 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 REEP5Q00765 189 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 RGS1Q08116 209 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 HYAL2Q12891 473 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 CSHL1Q14406 222 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 SPANXN3Q5MJ09 141 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 HECTD2Q5U5R9 776 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 QSOX2Q6ZRP7 698 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 KIAA0408Q6ZU52 694 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 DOLPP1Q86YN1 238 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 C4orf33Q8N1A6 199 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 HORMAD2Q8N7B1 307 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 AGAP11Q8TF27 550 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 CKAP2Q8WWK9 683 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 CERS2Q96G23 380 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 PAFAH2Q99487 392 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 SLC6A16Q9GZN6 736 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 AICDAQ9GZX7 198 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 RHBGQ9H310 441 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 KLHL31Q9H511 634 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 ACSS3Q9H6R3 686 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 NECTIN3Q9NQS3 549 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 ASB1Q9Y576 335 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa10.64□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 A8MUA0 341 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 ABCB7O75027 752 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 PTGER1P34995 402 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 AHRP35869 848 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 RFC3P40938 356 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 CYB561P49447 251 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 HLCSP50747 726 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 KRTAP10-9P60411 292 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 PPP1R3AQ16821 1122 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 HHATQ5VTY9 493 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 SBSNQ6UWP8 590 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 ABHD13Q7L211 337 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 GALNT7Q86SF2 657 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 TMPRSS11BQ86T26 416 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 GHDCQ8N2G8 530 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 TBC1D19Q8N5T2 526 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 ATL1Q8WXF7 558 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 MAGEB18Q96M61 343 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 DMRTA2Q96SC8 542 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 TRIM54Q9BYV2 358 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 FETUBQ9UGM5 382 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 PDZD2O15018 2839 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 CCDC168Q8NDH2 2452 aa10.63□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 PKDREJQ9NTG1 2253 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 CDC7O00311 574 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 INHBAP08476 426 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 SMIM10L1P0DMW3 83 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 RNH1P13489 461 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 MEOX1P50221 254 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 SKP1P63208 163 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 MPP2Q14168 576 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 RASA2Q15283 850 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 FAM45BPQ6NSW5 357 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 NIPAL1Q6NVV3 410 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 NXPE4Q6UWF7 544 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 C6orf89Q6UWU4 347 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 CA13Q8N1Q1 262 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 ARMC10Q8N2F6 343 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 APCDD1LQ8NCL9 501 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 TRPV3Q8NET8 790 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 FAM45AQ8TCE6 357 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 CREB3L4Q8TEY5 395 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 SMIM10Q96HG1 83 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 DEFB126Q9BYW3 111 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 PELI2Q9HAT8 420 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 GPAMQ9HCL2 828 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 PRDM9Q9NQV7 894 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa10.62□□□□□ -0.71
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZFATQ9P243 1243 aa10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms