RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 FRG2Q64ET8 278 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 SLC6A19Q695T7 634 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 ISLR2Q6UXK2 745 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 C4orf33Q8N1A6 199 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 FAM47BQ8NA70 645 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 TM9SF4Q92544 642 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 L3HYPDHQ96EM0 354 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 FRG2BQ96QU4 278 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 GRID1Q9ULK0 1009 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 PPT2Q9UMR5 302 aa19.66■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 TGFBR3LH3BV60 316 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 J3QKU1 62 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 COPEO14579 308 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 PLIN3O60664 434 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 TSFMP43897 325 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 RAP1GDS1P52306 607 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 HSD17B7P56937 341 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 IFFO1Q0D2I5 559 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 CUL3Q13618 768 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 BTBD16Q32M84 506 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 CCDC153Q494R4 210 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 CRB2Q5IJ48 1285 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 FAM219BQ5XKK7 198 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 LETMD1Q6P1Q0 360 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 ZYG11AQ6WRX3 759 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 LINC00696Q6ZRV3 163 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 ZNF595Q8IYB9 648 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 ZADH2Q8N4Q0 377 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 SIRT6Q8N6T7 355 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 Q8NA96 180 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 MYRIPQ8NFW9 859 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 M1APQ8TC57 530 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 PPP4R1Q8TF05 950 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 PNPLA2Q96AD5 504 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 LMF1Q96S06 567 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 LPAR4Q99677 370 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 CENPKQ9BS16 269 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 TRIM4Q9C037 500 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 PTGFRNQ9P2B2 879 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 LGALS13Q9UHV8 139 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa19.65■□□□□ 0.74
ACTB-211ENST00000480301 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa19.64■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 CLDN4O14493 209 aa19.64■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 OR4F21O95013 312 aa19.64■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 BSGP35613 385 aa19.64■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 AP2B1P63010 937 aa19.64■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 MFAP5Q13361 173 aa19.64■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 RCN2Q14257 317 aa19.64■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 Q6ZS92 163 aa19.64■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 TRABD2AQ86V40 505 aa19.64■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 ARMC2Q8NEN0 867 aa19.64■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 MMP25Q9NPA2 562 aa19.64■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 TRPS1Q9UHF7 1281 aa19.64■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 CSAG2Q9Y5P2 127 aa19.64■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 CTNSO60931 367 aa19.63■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 MYL2P10916 166 aa19.63■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 MLLT10P55197 1068 aa19.63■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 SLC26A5P58743 744 aa19.63■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 IFT88Q13099 833 aa19.63■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 SLAMF1Q13291 335 aa19.63■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 EXT1Q16394 746 aa19.63■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 H3F3CQ6NXT2 135 aa19.63■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP19.63■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 ZNF382Q96SR6 550 aa19.63■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 SERPINI1Q99574 410 aa19.63■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 TMEM109Q9BVC6 243 aa19.63■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 GSTO2Q9H4Y5 243 aa19.63■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 ELOVL6Q9H5J4 265 aa19.63■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 EPS8L2Q9H6S3 715 aa19.63■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 LUZP4Q9P127 313 aa19.63■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 FBXW2Q9UKT8 454 aa19.63■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 PLAAQ9Y263 795 aa19.63■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa19.63■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 A8MUA0 341 aa19.62■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 EEDO75530 441 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 SLC13A2Q13183 592 aa19.62■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 SGO1Q5FBB7 561 aa19.62■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 CLNKQ7Z7G1 428 aa19.62■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 BANPQ8N9N5 519 aa19.62■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 RDH11Q8TC12 318 aa19.62■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 ELP5Q8TE02 316 aa19.62■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 CCDC126Q96EE4 140 aa19.62■□□□□ 0.73
ACTB-211ENST00000480301 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
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