RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469334.5

SMARCE1-207, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 2,128 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-207ENST00000469334 IGHA2P01877 340 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 GSTM5P46439 218 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 BDKRB1P46663 353 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 ARSDP51689 593 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 CLCN7P51798 805 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 C2orf80Q0P641 193 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 SP140Q13342 867 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 DOC2BQ14184 412 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 P2RY14Q15391 338 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 PLK5Q496M5 336 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 NOMO2Q5JPE7 1267 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 DOK6Q6PKX4 331 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 AFTPHQ6ULP2 937 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 WASH2PQ6VEQ5 465 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 QSOX2Q6ZRP7 698 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 SHFQ7M4L6 423 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 GPSM1Q86YR5 675 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 NAXDQ8IW45 347 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 FAM46DQ8NEK8 389 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 SCARB1Q8WTV0 552 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 NELL1Q92832 810 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 PCYT2Q99447 389 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 OSMRQ99650 979 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 EQTNQ9NQ60 294 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 SLC6A13Q9NSD5 602 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 OSER1Q9NX31 292 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 BABAM2Q9NXR7 383 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 OR12D3Q9UGF7 316 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 HCN2Q9UL51 889 aa8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SMARCE1-207ENST00000469334 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 WWP2O00308 870 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 CDC7O00311 574 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 PLATP00750 562 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 FCER2P06734 321 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 FABP1P07148 127 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 HBQ1P09105 142 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 UGT2B7P16662 529 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 GPX2P18283 190 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 NNMTP40261 264 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 STC1P52823 247 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 CLDN8P56748 225 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 KCNJ10P78508 379 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 ABRAXAS2Q15018 415 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 Q3ZCU0 254 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 DACT2Q5SW24 774 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 C22orf42Q6IC83 251 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 PAQR3Q6TCH7 311 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 DENND1CQ8IV53 801 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 LGI4Q8N135 537 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 STPG2Q8N412 459 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 FTMTQ8N4E7 242 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 OR1M1Q8NGA1 313 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 OR52B6Q8NGF0 335 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 OR6S1Q8NH40 331 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 FAM151AQ8WW52 585 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 ACOT12Q8WYK0 555 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 KCNJ9Q92806 393 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 RFT1Q96AA3 541 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 MYO19Q96H55 970 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 ZNF251Q9BRH9 671 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 IER2Q9BTL4 223 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 DPH7Q9BTV6 452 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 DUSP16Q9BY84 665 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 HDHD2Q9H0R4 259 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 ABCG4Q9H172 646 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 LRTM1Q9HBL6 345 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 COMMD3Q9UBI1 195 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 FTSJ1Q9UET6 329 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 NDOR1Q9UHB4 597 aa8.65□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa8.64□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa8.64□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 I6L893 689 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 SUV39H1O43463 412 aa8.64□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 HPGDSO60760 199 aa8.64□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 RPP40O75818 363 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 RASGRP1O95267 797 aa8.64□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 KCNK5O95279 499 aa8.64□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 PRPS2P11908 318 aa8.64□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 KCNJ5P48544 419 aa8.64□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 CXCR3P49682 368 aa8.64□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 GPR17Q13304 367 aa8.64□□□□□ -1.03
SMARCE1-207ENST00000469334 MPEG1Q2M385 716 aa8.64□□□□□ -1.03
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