RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SHMT2P34897 504 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SOX18P35713 384 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PIGAP37287 484 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 MAGEA8P43361 318 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TSFMP43897 325 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CLDN2P57739 230 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 YPEL5P62699 121 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PHEXP78562 749 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 C2orf80Q0P641 193 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 BIRC2Q13490 618 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 MAP7Q14244 749 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SLC5A12Q1EHB4 618 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 LRIT3Q3SXY7 679 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 NADK2Q4G0N4 442 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CRB2Q5IJ48 1285 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 EOGTQ5NDL2 527 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 KDM4DQ6B0I6 523 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SDE2Q6IQ49 451 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ABHD17CQ6PCB6 329 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 IYDQ6PHW0 289 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF621Q6ZSS3 439 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CEP68Q76N32 757 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 VTCN1Q7Z7D3 282 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GALNT10Q86SR1 603 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF605Q86T29 641 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CYP4Z1Q86W10 505 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 NUDT13Q86X67 352 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 HS3ST5Q8IZT8 346 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 NAGSQ8N159 534 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CLEC4FQ8N1N0 589 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 DHRSXQ8N5I4 330 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 NATD1Q8N6N6 113 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 MFSD9Q8NBP5 474 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CCL4L1Q8NHW4 92 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 NT5CQ8TCD5 201 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GPBAR1Q8TDU6 330 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 KLHL6Q8WZ60 621 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 OR5P2Q8WZ92 322 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 FAM162AQ96A26 154 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TAMM41Q96BW9 452 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PPCDCQ96CD2 204 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 MS4A6EQ96DS6 147 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 NRBF2Q96F24 287 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 HSH2DQ96JZ2 352 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 WDR92Q96MX6 357 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 FERD3LQ96RJ6 166 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SIGLEC11Q96RL6 698 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PITX2Q99697 317 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PSD2Q9BQI7 771 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ACAT2Q9BWD1 397 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 KLHL31Q9H511 634 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CAAP1Q9H8G2 361 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SMURF2Q9HAU4 748 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TM9SF3Q9HD45 589 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 A4GALTQ9NPC4 353 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 THSD1Q9NS62 852 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ATAD3AQ9NVI7 634 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 FAM118AQ9NWS6 357 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 C2orf42Q9NWW7 574 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 OR6C2Q9NZP2 312 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFA13Q9P0J0 144 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PILRAQ9UKJ1 303 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CA5BQ9Y2D0 317 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 SNX11Q9Y5W9 270 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 V9GYQ6 96 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 KNL1Q8NG31 2342 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 CEP192Q8TEP8 1941 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D3EA0A087X179 549 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PRB8 838 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 FEZF1A0PJY2 475 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 ANKDD1BA6NHY2 528 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-210ENST00000462363 MYO1GB0I1T2 1018 aa5.36□□□□□ -1.55
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