RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440048.1

VARS-217, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VARS, Length 804 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-217ENST00000440048 SCELO95171 688 aa22.17■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 GSTA1P08263 222 aa22.17■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 TAC1P20366 129 aa22.17■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 SLC26A5P58743 744 aa22.17■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 PHEXP78562 749 aa22.17■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 WDR20Q8TBZ3 569 aa22.17■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 RGMAQ96B86 450 aa22.17■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 CSF3RQ99062 836 aa22.17■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 LYRM4Q9HD34 91 aa22.17■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 MMP25Q9NPA2 562 aa22.17■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 CLDN4O14493 209 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 DLX3O60479 287 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 SSR2P43308 183 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 NEK2P51955 445 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 RAP1GDS1P52306 607 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 CDH13P55290 713 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 HSD17B7P56937 341 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 RCN2Q14257 317 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 OR4C11Q6IEV9 310 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 SH2D5Q6ZV89 423 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 ZNF595Q8IYB9 648 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 IQCKQ8N0W5 287 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 CNDP1Q96KN2 507 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 KCNK13Q9HB14 408 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 PLA2G3Q9NZ20 509 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 DCDC2Q9UHG0 476 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 CLDN16Q9Y5I7 305 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 V9GYY5 206 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa22.16■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 A8MUA0 341 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 A8MUI8 341 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 TGFBR3LH3BV60 316 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 PPP6CO00743 305 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 PLPP1O14494 284 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 TSPAN8P19075 237 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 HERVK_113P63132 956 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 ARG2P78540 354 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 SLC13A2Q13183 592 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 RASA2Q15283 850 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 H3F3CQ6NXT2 135 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 MILR1Q7Z6M3 343 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 EFCAB3Q8N7B9 438 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 CATSPER1Q8NEC5 780 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 OR4F6Q8NGB9 312 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 CENPKQ9BS16 269 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 ERVK-6Q9BXR3 956 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 PSD3Q9NYI0 1048 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa22.15■■□□□ 1.14
VARS-217ENST00000440048 A0A1B0GTL3 188 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 DYTNA2CJ06 578 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 SAGE2PA6NJ88 616 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 ETHE1O95571 254 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 KRT15P19012 456 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 TSFMP43897 325 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 GGTA1PQ4G0N0 100 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 UNC50Q53HI1 259 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 ZNF678Q5SXM1 525 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 ABHD17BQ5VST6 288 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 FCRLBQ6BAA4 426 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 WDR93Q6P2C0 686 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 ATCAYQ86WG3 371 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 HAS2Q92819 552 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 TEKT2Q9UIF3 430 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 EMCNQ9ULC0 261 aa22.14■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 CTNSO60931 367 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 CDH16O75309 829 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 GLRA3O75311 464 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 WDPCPO95876 746 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 OTCP00480 354 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 F10P00742 488 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 ARFIP1P53367 373 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 CLCQ05315 142 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 ZNF33BQ06732 778 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 SLAMF1Q13291 335 aa22.13■■□□□ 1.13
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VARS-217ENST00000440048 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 TLR1Q15399 786 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 FRG2Q64ET8 278 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 LETMD1Q6P1Q0 360 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 CLNKQ7Z7G1 428 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 OR2W6PQ8NHA6 318 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 ELP5Q8TE02 316 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 TRPC4APQ8TEL6 797 aa22.13■■□□□ 1.13
VARS-217ENST00000440048 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
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