RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 POLBP06746 335 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 F7P08709 466 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLA2G2AP14555 144 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ETS1P14921 441 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 NR1D1P20393 614 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 DRD4P21917 467 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 IDSP22304 550 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADRA1DP25100 572 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 OAS2P29728 719 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CXCR5P32302 372 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ADRA1AP35348 466 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 GSTM5P46439 218 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 DIO1P49895 249 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 DGKQP52824 942 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 POLE2P56282 527 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPS18P62269 152 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CRADDP78560 199 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 BASP1P80723 227 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNASE1L3Q13609 305 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT33BQ14525 404 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPE65Q16518 533 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 DEFB110Q30KQ9 67 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 P3H1Q32P28 736 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYTL3Q4VX76 610 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCID2Q5JVF3 399 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 LDLRAP1Q5SW96 308 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCAF12Q5T6F0 453 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM69BQ5VUD6 431 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CEACAM20Q6UY09 585 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM26Q6ZUK4 368 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAS2R42Q7RTR8 314 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM73Q86UV7 250 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SERPINA9Q86WD7 417 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 P3H2Q8IVL5 708 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SYCE1Q8N0S2 351 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLDN19Q8N6F1 224 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 OTUD6BQ8N6M0 293 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 AMER2Q8N7J2 671 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 BMPERQ8N8U9 685 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC89Q8N998 374 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 DNAAF3Q8N9W5 541 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR52K1Q8NGK4 314 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 HM13Q8TCT9 377 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR60Q8WVS4 1066 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 C1orf54Q8WWF1 131 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 STARD8Q92502 1023 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM159Q96B96 161 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 DCUN1D1Q96GG9 259 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 C9orf72Q96LT7 481 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR6C1Q96RD1 312 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 RUFY1Q96T51 708 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDA1Q9BW61 102 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRABDQ9H4I3 376 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 POT1Q9NUX5 634 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMOXQ9NWM0 555 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 HACD3Q9P035 362 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL17BQ9UHF5 180 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PLAGL1Q9UM63 463 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 DAPP1Q9UN19 280 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZGRF1Q86YA3 2104 aa4.27□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 LRRK2Q5S007 2527 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A087X1B8 175 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 GXYLT2A0PJZ3 443 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC162PA2VCL2 907 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR6C74A6NCV1 312 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR5K3A6NET4 321 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TLCD2A6NGC4 264 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 BTNL10A8MVZ5 291 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 B4E171 279 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR89AB7ZAQ6 455 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 B9A039 149 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 LDB2O43679 373 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 LIASO43766 372 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMPRSS11DO60235 418 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRAMEF2O60811 474 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 POP7O75817 140 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM155BO75949 473 aa4.26□□□□□ -1.73
RPS3AP54-201ENST00000435535 AP2A1O95782 977 aa4.26□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms