RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430918.5

HDLBP-217, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene HDLBP, Length 612 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-217ENST00000430918 DR1Q01658 176 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 TGFBIQ15582 683 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 ZNF750Q32MQ0 723 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 TMEM211Q6ICI0 200 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 ZNF595Q8IYB9 648 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 KRT78Q8N1N4 520 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 ZNF321PQ8N8H1 164 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 ACBD4Q8NC06 268 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 TTLQ8NG68 377 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 OR2L5Q8NG80 312 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 ANKRD7Q92527 254 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 RASL10BQ96S79 203 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 SERINC2Q96SA4 455 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 CAB39LQ9H9S4 337 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 MCCC2Q9HCC0 563 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 ADAP2Q9NPF8 381 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 SMYD2Q9NRG4 433 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 WWOXQ9NZC7 414 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 DAPP1Q9UN19 280 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 EML6Q6ZMW3 1958 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 NPIPA2E9PIF3 369 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 NPIPA3F8WFD2 350 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 ACOT7O00154 380 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 CYR61O00622 381 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 CLGNO14967 610 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 FANCGO15287 622 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 ZSCAN12O43309 604 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 PRAMEF4O60810 478 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 LDB3O75112 727 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 CLEC3AO75596 197 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 TCP1P17987 556 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 TNNI3P19429 210 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 CHRNB4P30926 498 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 HSPA7P48741 367 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 HK2P52789 917 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 SLC12A2P55011 1212 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 MTTPP55157 894 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 NUP107P57740 925 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 PMPCAQ10713 525 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 STX4Q12846 297 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 ADPRMQ3LIE5 342 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 EMC4Q5J8M3 183 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 ABHD17CQ6PCB6 329 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 HSDL2Q6YN16 418 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 ZBED8Q8IZ13 594 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 SNX31Q8N9S9 440 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 OR2M7Q8NG81 312 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 OR5M9Q8NGP3 310 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 OR5M3Q8NGP4 307 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 ASB5Q8WWX0 329 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 RND1Q92730 232 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 VPS39Q96JC1 886 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 F2RL3Q96RI0 385 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 TTTY12Q9BZ98 90 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 OR8D2Q9GZM6 311 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 RHOJQ9H4E5 214 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 NT5DC2Q9H857 520 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 PNPLA3Q9NST1 481 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 DNAJC11Q9NVH1 559 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 MOCS1Q9NZB8 636 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 GPRC5BQ9NZH0 403 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 MYOTQ9UBF9 498 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 LIPGQ9Y5X9 500 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa9.48□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 C17orf105B2RV13 164 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 RTCAO00442 366 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 TP73O15350 636 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 CTNSO60931 367 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 SH3BGRLO75368 114 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 TOXO94900 526 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 CCDC166P0CW27 439 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 CD22P20273 847 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 GSTM2P28161 218 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 ID2Q02363 134 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 TFF3Q07654 80 aa9.47□□□□□ -0.89
HDLBP-217ENST00000430918 DOC2AQ14183 400 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms