RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429899.1

ATG4B-211, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-211ENST00000429899 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 ESAMQ96AP7 390 aa9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 CCDC138Q96M89 665 aa9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 C12orf66Q96MD2 445 aa9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF382Q96SR6 550 aa9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 C17orf62Q9BQA9 187 aa9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 TRIM54Q9BYV2 358 aa9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 CD244Q9BZW8 370 aa9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 FAM107BQ9H098 131 aa9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 C1GALT1Q9NS00 363 aa9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 SPATA7Q9P0W8 599 aa9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 KCNN3Q9UGI6 736 aa9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 POMT2Q9UKY4 750 aa9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 ASF1AQ9Y294 204 aa9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 RAP2CQ9Y3L5 183 aa9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 DYTNA2CJ06 578 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 NKX2-6A6NCS4 301 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 K7EPI3 171 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 PPP6CO00743 305 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 OR7A17O14581 309 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF195O14628 629 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 ADAM10O14672 748 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 PRAMEF2O60811 474 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 RPN2P04844 631 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 HBQ1P09105 142 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 TSPAN8P19075 237 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 HIST1H2ADP20671 130 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 PKLRP30613 574 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 CDH13P55290 713 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 TBPL1P62380 186 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 TFF3Q07654 80 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 PRKAA1Q13131 559 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 GTF2H2Q13888 395 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 CFAP157Q5JU67 520 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 FAM219BQ5XKK7 198 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 KANK2Q63ZY3 851 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 RHBDD2Q6NTF9 364 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 ARMC6Q6NXE6 501 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 AGTRAPQ6RW13 159 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 SPATA21Q7Z572 469 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 SPPL2CQ8IUH8 684 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 CRLF3Q8IUI8 442 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 OR11G2Q8NGC1 345 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 OR52B6Q8NGF0 335 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 OR9A1PQ8NGU1 263 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 RFWD2Q8NHY2 731 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 BCAS4Q8TDM0 211 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 ATL1Q8WXF7 558 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 RAD51AP1Q96B01 352 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 HIST1H2AJQ99878 128 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 H2AFJQ9BTM1 129 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 HGH1Q9BTY7 390 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 SGPP1Q9BX95 441 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.896e-9■□□□□ 10.6
ATG4B-211ENST00000429899 MVB12BQ9H7P6 319 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 FAM60AQ9NP50 221 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 NPHS2Q9NP85 383 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 PNPOQ9NVS9 261 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 COQ3Q9NZJ6 369 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 LRFN1Q9P244 771 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 KLHL14Q9P2G3 628 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 OPTCQ9UBM4 332 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 CIDEBQ9UHD4 219 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF225Q9UK10 706 aa9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 SONP18583 2426 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 FAM90A27PA6NNH2 459 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 TMEM233B4DJY2 109 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 NDUFAB1O14561 156 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 STK16O75716 305 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 WDR47O94967 919 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 MLYCDO95822 493 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 JUNP05412 331 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 CD63P08962 238 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.894e-6■□□□□ 9.4
ATG4B-211ENST00000429899 ITGAXP20702 1163 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 GDF5P43026 501 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 PIK3CGP48736 1102 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 HK2P52789 917 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 PKNOX1P55347 436 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 E2F2Q14209 437 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 ARHGAP19Q14CB8 494 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 DEFB110Q30KQ9 67 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 SH2D4BQ5SQS7 431 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 CPLX4Q7Z7G2 160 aa9.5□□□□□ -0.89
ATG4B-211ENST00000429899 TEX9Q8N6V9 391 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms