RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414253.5

FAAP20-206, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,216 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-206ENST00000414253 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 IMPAD1Q9NX62 359 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 DUSP12Q9UNI6 340 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 CFL2Q9Y281 166 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 ITM2BQ9Y287 266 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 KIAA0513O60268 411 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 HLA-EP13747 358 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 PREPP48147 710 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 SF1Q15637 639 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 C12orf40Q86WS4 652 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 OR52J3Q8NH60 311 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 FOXJ1Q92949 421 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM159Q96B96 161 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 AP2M1Q96CW1 435 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 CCDC32Q9BV29 185 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 MS4A12Q9NXJ0 267 aa23.48■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 A8MVJ9 347 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 PCDH7O60245 1069 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 KRT8P05787 483 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 ADH5P11766 374 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 TNFRSF1BP20333 461 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 CDH12P55289 794 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 IFI44LQ53G44 452 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 ANXA8L1Q5VT79 327 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 ERAP2Q6P179 960 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 C19orf48Q6RUI8 117 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 B3GNT7Q8NFL0 401 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 ATG13O75143 517 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 OPN1SWP03999 348 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 ASMTP46597 345 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 PRLHRP49683 370 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 CAMKMTQ7Z624 323 aa23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF197O14709 1029 aa23.46■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 CCSMST1Q4G0I0 132 aa23.46■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 XKR6Q5GH73 641 aa23.46■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 CDCA4Q9BXL8 241 aa23.46■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 SLC5A10A0PJK1 596 aa23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 SLC15A1P46059 708 aa23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 NAE1Q13564 534 aa23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF544Q6NX49 715 aa23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 AGTRAPQ6RW13 159 aa23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 TAS2R16Q9NYV7 291 aa23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF221Q9UK13 617 aa23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 MAPRE3Q9UPY8 281 aa23.45■■□□□ 1.35
FAAP20-206ENST00000414253 E7EQ34 232 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 M0R129 80 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 SSX4O60224 188 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 MYOGP15173 224 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 OR1E2P47887 323 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 OR2B6P58173 313 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ST8SIA6P61647 398 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 RAE1P78406 368 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 UBE3AQ05086 875 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 TSTQ16762 297 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 TMEM220Q6QAJ8 160 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ATCAYQ86WG3 371 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 RSPRY1Q96DX4 576 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 CEP19Q96LK0 163 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 OR5M11Q96RB7 305 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 MGLLQ99685 303 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 SLC30A2Q9BRI3 323 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 OR2B2Q9GZK3 357 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 ZNF556Q9HAH1 456 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 NOX1Q9Y5S8 564 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 LRRK1Q38SD2 2015 aa23.45■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 A0A075B6Q4 140 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 LINC01553A4QN01 128 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 EFCAB10A6NFE3 127 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 PDZK1P1A8MUH7 402 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 CTDSP2O14595 271 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 CATP04040 527 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 IDSP22304 550 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 BDKRB1P46663 353 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 METAP1P53582 386 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 MESP2Q0VG99 397 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 DOC2AQ14183 400 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 MED22Q15528 200 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 NRSN1Q8IZ57 195 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 OR9Q2Q8NGE9 314 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 OR6F1Q8NGZ6 308 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 TP53INP1Q96A56 240 aa23.44■■□□□ 1.34
FAAP20-206ENST00000414253 COQ8BQ96D53 544 aa23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms