RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 WASHC1A8K0Z3 465 aa3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MYO1GB0I1T2 1018 aa3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 hCG_2039718K7EN88 272 aa3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 HAT1O14929 419 aa3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 KDM1AO60341 852 aa3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SEMA3DO95025 777 aa3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PRSS23O95084 383 aa3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 ALBP02768 609 aa3.79□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 OR4C11Q6IEV9 310 aa3.79□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 WASH2PQ6VEQ5 465 aa3.79□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP3.79□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 LINC00528Q8N1L1 170 aa3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 SYNPOQ8N3V7 929 aa3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 C11orf65Q8NCR3 313 aa3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2L3Q8NG85 312 aa3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 OR13H1Q8NG92 308 aa3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 RLN3Q8WXF3 142 aa3.79□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 MTERF3Q96E29 417 aa3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 GPR174Q9BXC1 333 aa3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKRD60Q9BZ19 345 aa3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MAGIXQ9H6Y5 334 aa3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 NT5DC2Q9H857 520 aa3.79□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 GPATCH2Q9NW75 528 aa3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 C2orf42Q9NWW7 574 aa3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF639Q9UID6 485 aa3.79□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 BAG5Q9UL15 447 aa3.79□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 TRBC2A0A5B9 178 aa3.78□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 LRIT2A6NDA9 550 aa3.78□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 BTN3A3O00478 584 aa3.78□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 ERI3O43414 337 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 OPN1SWP03999 348 aa3.78□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
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LRRTM4-201ENST00000409088 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP3.78□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 LIN52Q52LA3 116 aa3.78□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 CYBRD1Q53TN4 286 aa3.78□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 PRRT3Q5FWE3 981 aa3.78□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 MFSD4BQ5TF39 518 aa3.78□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 FOXB2Q5VYV0 432 aa3.78□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 IKBIPQ70UQ0 350 aa3.78□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR155Q7Z3F1 870 aa3.78□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa3.78□□□□□ -1.8
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIM48Q8IWZ4 208 aa3.78□□□□□ -1.8
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