RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 HLA-DRAP01903 254 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 C1QAP02745 245 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 RAF1P04049 648 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 NEFHP12036 1026 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 SSTR1P30872 391 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 YWHABP31946 246 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 RPL22P35268 128 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 PEX19P40855 299 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 CETN2P41208 172 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 PIK3CAP42336 1068 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 CDKN2BP42772 138 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 QARSP47897 775 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 MMP15P51511 669 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 ARSEP51690 589 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 RAP1GDS1P52306 607 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 VCPP55072 806 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 CDK16Q00536 496 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 OGDHQ02218 1023 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 SLC34A1Q06495 639 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 AP1B1Q10567 949 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 OVGP1Q12889 678 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 BIRC2Q13490 618 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 MORF4L2Q15014 288 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 TAZQ16635 292 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 UGCGQ16739 394 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 LRRC38Q5VT99 294 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 SNX30Q5VWJ9 437 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 ANKRD22Q5VYY1 191 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 CENPUQ71F23 418 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 GSTA5Q7RTV2 222 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 GPD1LQ8N335 351 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 SLC5A8Q8N695 610 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 GCSAMQ8N6F7 178 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 NAT8LQ8N9F0 302 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 TCP10LQ8TDR4 215 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 CHURC1Q8WUH1 139 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 AZIN2Q96A70 460 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 SKA1Q96BD8 255 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 TSC22D3Q99576 134 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 C11orf70Q9BRQ4 267 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 SYNCQ9H7C4 482 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 VPS37BQ9H9H4 285 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.884e-7■■■■■ 29
PTPRK-202ENST00000368205 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 SLC17A7Q9P2U7 560 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 EXOC7Q9UPT5 735 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF148Q9UQR1 794 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 YIPF1Q9Y548 306 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 ARID2Q68CP9 1835 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 F8VP50 259 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 GOLGA8SH3BPF8 625 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 GOLGA8MH3BSY2 632 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 NDC80O14777 642 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 TM9SF1O15321 606 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 GYG2O15488 501 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 CCNE2O96020 404 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 NGFP01138 241 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 MT-ND3P03897 115 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRK-202ENST00000368205 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 MYL2P10916 166 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 ANPEPP15144 967 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 BGNP21810 368 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 GLRA2P23416 452 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 ALDH1B1P30837 517 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRK-202ENST00000368205 STAT2P52630 851 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 PSMC5P62195 406 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 CUL2Q13617 745 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 TFDP1Q14186 410 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 RCN2Q14257 317 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 PSMD6Q15008 389 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 RCN1Q15293 331 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 TEAD2Q15562 447 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 CDONQ4KMG0 1287 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 ARHGEF16Q5VV41 709 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 CES4AQ5XG92 561 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 AP1ARQ63HQ0 302 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 SPOPLQ6IQ16 392 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRK-202ENST00000368205 Q6ZSR9 355 aa3.29□□□□□ -1.88
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