RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366661.8

TTC13-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC13, Length 3,253 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC13-201ENST00000366661 SHFQ7M4L6 423 aa14.74□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 RDH10Q8IZV5 341 aa14.74□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 RNF175Q8N4F7 328 aa14.74□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ZNF366Q8N895 744 aa14.74□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 GDPD1Q8N9F7 314 aa14.74□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 SPNS1Q9H2V7 528 aa14.74□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 LIN7BQ9HAP6 207 aa14.74□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ZNF98A6NK75 572 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 H3BN98 237 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 J3KR12 359 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 J3KTA2 159 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 GALTP07902 379 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ACPPP15309 386 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 CAPZA2P47755 286 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 LRRC74AQ0VAA2 488 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 CNTN4Q8IWV2 1026 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 TCTE3Q8IZS6 198 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 IPPKQ9H8X2 491 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 NUDT15Q9NV35 164 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 MARCH5Q9NX47 278 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 CHD7Q9P2D1 2997 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 CBX7O95931 251 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 SRCP12931 536 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 COQ5Q5HYK3 327 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ALKAL2Q6UX46 152 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 TRILQ7L0X0 811 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 FAM9CQ8IZT9 166 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 TAGAPQ8N103 731 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 UROC1Q96N76 676 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 SAP130Q9H0E3 1048 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 MIXL1Q9H2W2 232 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 NIPAL2Q9H841 368 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 UBQLN2Q9UHD9 624 aa14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 RAB19A4D1S5 217 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 CPN2P22792 545 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 CXCR4P61073 352 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 SLC10A7Q0GE19 358 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 HKDC1Q2TB90 917 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 GPR149Q86SP6 731 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 STPG2Q8N412 459 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 OR10G2Q8NGC3 310 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 NT5C3BQ969T7 300 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 PKMYT1Q99640 499 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 NTMT1Q9BV86 223 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 PCTPQ9UKL6 214 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 SCN5AQ14524 2016 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ACSM4P0C7M7 580 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 DRD5P21918 477 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 OLR1P78380 273 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 GRK1Q15835 563 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 FAM209BQ5JX69 171 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 TMEM145Q8NBT3 493 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 UXS1Q8NBZ7 420 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ASAH2Q9NR71 780 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 MGAT4BQ9UQ53 548 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 MIA3Q5JRA6 1907 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 LCHNA4D1U4 455 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 NCAM2O15394 837 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 SIX6O95475 246 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 RAF1P04049 648 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ALPPP05187 535 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ALPIP09923 528 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 SRP9P49458 86 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 INSL4Q14641 139 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ATRAIDQ6UW56 229 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ZZZ3Q8IYH5 903 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ART5Q96L15 291 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 CXorf58Q96LI9 332 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 PANX1Q96RD7 426 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 TBC1D17Q9HA65 648 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 KLHL21Q9UJP4 597 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 FBXL2Q9UKC9 423 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 PADI2Q9Y2J8 665 aa14.72□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ARID1AO14497 2285 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 A0A0A6YYJ9 748 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 A0A1W2PPL8 197 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 PRRG1O14668 218 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 TNK1Q13470 666 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ASAH1Q13510 395 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 SUSD1Q6UWL2 747 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 USP30Q70CQ3 517 aa14.71□□□□□ -0.05
TTC13-201ENST00000366661 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms