RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366391.6

SH3BP5-201, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-201ENST00000366391 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP17.32■□□□□ 0.365e-7■■■■■ 45.6
SH3BP5-201ENST00000366391 ATP6V1E2Q96A05 226 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 REPS1Q96D71 796 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 CDK15Q96Q40 435 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 CSF3RQ99062 836 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 NTMT1Q9BV86 223 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 RNF32Q9H0A6 362 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 LYRM4Q9HD34 91 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 KCMF1Q9P0J7 381 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM216Q9P0N5 145 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 TBK1Q9UHD2 729 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 TEKT2Q9UIF3 430 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 NTNG1Q9Y2I2 539 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 CLDN16Q9Y5I7 305 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 LRRK2Q5S007 2527 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 SAGE2PA6NJ88 616 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 A8MT66 165 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 A8MUA0 341 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 TGFBR3LH3BV60 316 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 GOLGA8RI6L899 631 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 SAP18O00422 153 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 CYR61O00622 381 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 WDPCPO95876 746 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 F10P00742 488 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 RPS17P08708 135 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 SSR2P43308 183 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 UQCRFS1P47985 274 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 TNFSF10P50591 281 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 CCNG1P51959 295 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 RPS13P62277 151 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 PHEXP78562 749 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 TRAF3Q13114 568 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC13A2Q13183 592 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 RCN2Q14257 317 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 FCRLBQ6BAA4 426 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 LCA5Q86VQ0 697 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 CNPY4Q8N129 248 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 WDR20Q8TBZ3 569 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 ACMSDQ8TDX5 336 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 ELP5Q8TE02 316 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF354BQ96LW1 612 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC29A3Q9BZD2 475 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 STMN3Q9NZ72 180 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 SHBGP04278 402 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 PYGBP11216 843 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 GNLYP22749 145 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 RAP1GDS1P52306 607 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 ACER2Q5QJU3 275 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 OR4C11Q6IEV9 310 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 CRLF3Q8IUI8 442 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 OR1N1Q8NGS0 311 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 RGMAQ96B86 450 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 NPAS2Q99743 824 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 MYO7BQ6PIF6 2116 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 TRAV17A0A0B4J275 112 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 OR5H15A6NDH6 313 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 TCP11X1B4DZS4 312 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 PLPP1O14494 284 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 CTNSO60931 367 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 NEK2P51955 445 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 ARFIP1P53367 373 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 TAS2R50P59544 299 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 MEP1AQ16819 746 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 CLNKQ7Z7G1 428 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 BEST3Q8N1M1 668 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 KIF2BQ8N4N8 673 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC5A8Q8N695 610 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 CENPKQ9BS16 269 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 PSD3Q9NYI0 1048 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 SPACA6W5XKT8 324 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 EXPH5Q8NEV8 1989 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 COL12A1Q99715 3063 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 ICE1Q9Y2F5 2266 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 A0A1W2PPM1 405 aa17.28■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms