RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 PSPHP78330 225 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 SYNPOQ8N3V7 929 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 TOP6BLQ8N6T0 577 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 MTMR14Q8NCE2 650 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 OR7G3Q8NG95 312 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 USP7Q93009 1102 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 CCDC115Q96NT0 180 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 GPR20Q99678 358 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 IFT27Q9BW83 186 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 NT5DC2Q9H857 520 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 OR6C2Q9NZP2 312 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 ARPC5O15511 151 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 KIR2DL3P43628 341 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 SLC11A2P49281 568 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 KCTD11Q693B1 232 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 CFAP52Q8N1V2 620 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 FBXW5Q969U6 566 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 KLHL28Q9NXS3 571 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 CACNG4Q9UBN1 327 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 PBX3P40426 434 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 LILRA4P59901 499 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 KDM4DQ6B0I6 523 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 DLEU7Q6UYE1 221 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 KLHL36Q8N4N3 616 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 TCEAL3Q969E4 200 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 DYRK1BQ9Y463 629 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 RASGRP1O95267 797 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 MFSD10Q14728 455 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 ZNF366Q8N895 744 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 HRASLS5Q96KN8 279 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 ATOH8Q96SQ7 321 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 POPDC3Q9HBV1 291 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 BIN3Q9NQY0 253 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 GPRC5BQ9NZH0 403 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 GPX5O75715 221 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 CH25HO95992 272 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 RPS17P08708 135 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 ATXN8OSP0DMR3 200 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 SLC19A1P41440 591 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 PTGER3P43115 390 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 TIGD3Q6B0B8 471 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 ZNF607Q96SK3 696 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 SDHAF2Q9NX18 166 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 MARCH2Q9P0N8 246 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 MUSKO15146 869 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 REM1O75628 298 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 TFP02787 698 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 CHMP24386 653 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 ASMTP46597 345 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 CDK6Q00534 326 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 NKG7Q16617 165 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 TSGA13Q96PP4 275 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 MTG2Q9H4K7 406 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 XKR8Q9H6D3 395 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 HEBP1Q9NRV9 189 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 DERAQ9Y315 318 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 WNK3Q9BYP7 1800 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 METTL21EPA6NDL7 271 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 BEST1O76090 585 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 CSF3P09919 207 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 PRMT2P55345 433 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 TEKQ02763 1124 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 OLFML2AQ68BL7 652 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 TMEM86AQ8N2M4 240 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 ZBTB2Q8N680 514 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 DNAJB3Q8WWF6 145 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 RFKQ969G6 155 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 TREX1Q9NSU2 369 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 NRCAMQ92823 1304 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 DSCR3O14972 297 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 IL1AP01583 271 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 APOC1P02654 83 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 RHOQP17081 205 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-201ENST00000320580 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
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