RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 NLNQ9BYT8 704 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CD320Q9NPF0 282 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 EGFL7Q9UHF1 273 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 VPS4AQ9UN37 437 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 BTBD3Q9Y2F9 522 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHL20Q9Y2M5 609 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa9.62□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0J9YVX5 310 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PRB8 838 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ELOVL7A1L3X0 281 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ARPC2O15144 300 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PIAS2O75928 621 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 UBXN7O94888 489 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SCELO95171 688 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 GPIP06744 558 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM58BPP0C7Q3 252 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM157BP0CG42 384 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ENGP17813 658 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PTPN6P29350 595 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 MC1RQ01726 317 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 DMWDQ09019 674 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ABHD18Q0P651 414 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 MTX3Q5HYI7 312 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TSSK4Q6SA08 328 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 UBE3DQ7Z6J8 389 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM73Q86UV7 250 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TICAM1Q8IUC6 712 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SPPL2CQ8IUH8 684 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 C1orf210Q8IVY1 113 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 MSRB3Q8IXL7 192 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PQLC1Q8N2U9 271 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ACOT4Q8N9L9 421 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4A15Q8NGL6 344 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 NT5CQ8TCD5 201 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 MIEF2Q96C03 454 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 NSMCE2Q96MF7 247 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2A5Q96R48 311 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 C17orf62Q9BQA9 187 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 RAD21L1Q9H4I0 556 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PIF1Q9H611 641 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TPT1P8Q9HAU6 139 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TAS2R7Q9NYW3 318 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PSME2Q9UL46 239 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 REV3LO60673 3130 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GVT2 93 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PNR3 127 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 DHRS12A0PJE2 317 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 LILRA5A6NI73 299 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 RHPN2P1A8MT19 583 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TXNDC9O14530 226 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PPM1DO15297 605 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHL18O94889 574 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 KRT75O95678 551 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 TYRP1P17643 537 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 GPX2P18283 190 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ALDH9A1P49189 494 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 MANFP55145 182 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SLAMF1Q13291 335 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SELPLGQ14242 412 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 FXNQ16595 210 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP51A1Q16850 503 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 FCRL6Q6DN72 434 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ERICH5Q6P6B1 374 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 ABHD13Q7L211 337 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 SERPINA11Q86U17 422 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM47BQ8NA70 645 aa9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms