RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 LATO43561 262 aa22.83■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 CSNK1G2P78368 415 aa22.83■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 NFATC3Q12968 1075 aa22.83■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 ADCK2Q7Z695 626 aa22.83■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 THAP11Q96EK4 314 aa22.83■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 CAMK1GQ96NX5 476 aa22.83■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa22.83■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 NEUROD4Q9HD90 331 aa22.83■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 AASSQ9UDR5 926 aa22.83■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa22.83■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa22.83■■□□□ 1.25
TRIM54-201ENST00000296098 CDH23Q9H251 3354 aa22.83■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 E9PQ18 207 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 GSTM5P46439 218 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 STT3AP46977 705 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 RAB28P51157 221 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 RPP38P78345 283 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 SAXO2Q658L1 398 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 LAIR1Q6GTX8 287 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 OR4C15Q8NGM1 316 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 NEURL3Q96EH8 262 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 ABCG4Q9H172 646 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 FBXL12Q9NXK8 326 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 MANFP55145 182 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 CDH12P55289 794 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 SLC35A2P78381 396 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 PPP2R2DQ66LE6 453 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 OR10G2Q8NGC3 310 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 DUSP21Q9H596 190 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 XKR8Q9H6D3 395 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 RMI1Q9H9A7 625 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 ERVK-18Q9QC07 812 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 ADAM29Q9UKF5 820 aa22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 A0A1W2PQU0 124 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 PRAMEF25A6NGN4 478 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 TMPRSS11DO60235 418 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 CEACAM5P06731 702 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 PKLRP30613 574 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 TNFRSF4P43489 277 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 GALK1P51570 392 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 KIAA1211LQ6NV74 962 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 CEACAM20Q6UY09 585 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 ARMC8Q8IUR7 673 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 OR14C36Q8NHC7 312 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 FEVQ99581 238 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 TMEM184CQ9NVA4 438 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 RAB23Q9ULC3 237 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 K7EQS6 105 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 INMTO95050 263 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 CD247P20963 164 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 IGFALSP35858 605 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 GP2P55259 537 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 PROX2Q3B8N5 592 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 PLD3Q8IV08 490 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 OR2L8Q8NGY9 312 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 FAR1Q8WVX9 515 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 HRASLS5Q96KN8 279 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 FUNDC2Q9BWH2 189 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 BTBD1Q9H0C5 482 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.81■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 FAM20BO75063 409 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 CLEC3AO75596 197 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 LAMP2P13473 410 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 KRT20P35900 424 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 FRKP42685 505 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 EMP3P54852 163 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 HSPB3Q12988 150 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 KRT33BQ14525 404 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 NPTX1Q15818 432 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 CYP27C1Q4G0S4 372 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 REEP3Q6NUK4 255 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 UBE3DQ7Z6J8 389 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 LGI4Q8N135 537 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 SLC5A8Q8N695 610 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 SMYD1Q8NB12 490 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 OR2A1Q8NGT9 310 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 PDXPQ96GD0 296 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 SLC17A9Q9BYT1 436 aa22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TRIM54-201ENST00000296098 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms