RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293889.10

CCDC78-201, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC78, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-201ENST00000293889 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 CUTCQ9NTM9 273 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 KLK13Q9UKR3 277 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 LOXL2Q9Y4K0 774 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 NCOR2Q9Y618 2525 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 SCN3AQ9NY46 2000 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF749O43361 778 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 TMPRSS11DO60235 418 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 PRPS2P11908 318 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 FGF5P12034 268 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 MTTPP55157 894 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 NME5P56597 212 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 FAM53BQ14153 422 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 IL11RAQ14626 422 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 PTGR1Q14914 329 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 RPS6KA2Q15349 733 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 MUM1Q2TAK8 710 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 FAM214AQ32MH5 1076 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 RAB11FIP2Q7L804 512 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 GALNT15Q8N3T1 639 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 OR9A4Q8NGU2 314 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 CLHC1Q8NHS4 586 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 FBXO27Q8NI29 283 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 SLC45A3Q96JT2 553 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 TSSK3Q96PN8 268 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 CTRCQ99895 268 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 SCNM1Q9BWG6 230 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 BRINP2Q9C0B6 783 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 ROGDIQ9GZN7 287 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 ANKHQ9HCJ1 492 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 FBXO8Q9NRD0 319 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 SLC7A8Q9UHI5 535 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 AKAP13Q12802 2813 aa16.85■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 A0A088AWK7 358 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 ARHGAP10A1A4S6 786 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF860A6NHJ4 632 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 B4E171 279 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 I3L1I5 382 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 FOXS1O43638 330 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 DNAJB6O75190 326 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 SCELO95171 688 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 TIAF1O95411 115 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 TSPAN7P41732 249 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 ATP4BP51164 291 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 MAPK12P53778 367 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 KLC1Q07866 573 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 SLAMF1Q13291 335 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 ERMP1Q7Z2K6 904 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 PPP1R3BQ86XI6 285 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 C16orf78Q8WTQ4 265 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 RNF31Q96EP0 1072 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 EGLN2Q96KS0 407 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 SERINC2Q96SA4 455 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 NDC1Q9BTX1 674 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 ACTL8Q9H568 366 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 SLC39A1Q9NY26 324 aa16.84■□□□□ 0.29
CCDC78-201ENST00000293889 PMS2P1A4D2B8 440 aa16.83■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 SGK494L7N484 410 aa16.83■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 ANKRD28O15084 1053 aa16.83■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 ITIH1P19827 911 aa16.83■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 GPX3P22352 226 aa16.83■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 CPA2P48052 419 aa16.83■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 STX1BP61266 288 aa16.83■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF763Q0D2J5 394 aa16.83■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 SQLEQ14534 574 aa16.83■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 TTLL10Q6ZVT0 673 aa16.83■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 MIER2Q8N344 545 aa16.83■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 CDC26Q8NHZ8 85 aa16.83■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP16.83■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa16.83■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 CCDC187A0A096LP49 1063 aa16.82■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 SLC22A2O15244 555 aa16.82■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 B3GALT2O43825 422 aa16.82■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 SCRG1O75711 98 aa16.82■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 FAM58BPP0C7Q3 252 aa16.82■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 ANPEPP15144 967 aa16.82■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 ALAS2P22557 587 aa16.82■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 ETV5P41161 510 aa16.82■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 ARSFP54793 590 aa16.82■□□□□ 0.28
CCDC78-201ENST00000293889 TAS2R50P59544 299 aa16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms