RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283882.3

CFDP1-201, Transcript of craniofacial development protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CFDP1, Length 1,275 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1-201ENST00000283882 WASHC2DQ5SRD0 308 aa11.85□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 SLC2A7Q6PXP3 512 aa11.85□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 DLEU7Q6UYE1 221 aa11.85□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa11.85□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 SCUBE1Q8IWY4 988 aa11.85□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 ULK2Q8IYT8 1036 aa11.85□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 FAM47BQ8NA70 645 aa11.85□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 OR7A2PQ8NGA2 310 aa11.85□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 OR8J3Q8NGG0 315 aa11.85□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa11.85□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 CGREF1Q99674 301 aa11.85□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 MACROD1Q9BQ69 325 aa11.85□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 NUDT22Q9BRQ3 303 aa11.85□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 LRFN3Q9BTN0 628 aa11.85□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 TMEM181Q9P2C4 612 aa11.85□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 BTBD3Q9Y2F9 522 aa11.85□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 MYO15AQ9UKN7 3530 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 A0A1W2PQM1 296 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 H3BMH7 237 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 ZCCHC18P0CG32 403 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 LAMP1P11279 417 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 SLC6A2P23975 617 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 PTPN6P29350 595 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 NBL1P41271 181 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 FRKP42685 505 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 GCGRP47871 477 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 RAB8AP61006 207 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 BTN3A2P78410 334 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 CCL7P80098 99 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 TNFRSF17Q02223 184 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 SLAMF1Q13291 335 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 GRM7Q14831 915 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 CSRP2Q16527 193 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 DEFB110Q30KQ9 67 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 PGS1Q32NB8 556 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 PIGGQ5H8A4 983 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 OR4F3Q6IEY1 312 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 TICAM1Q8IUC6 712 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 FBXW8Q8N3Y1 598 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 MVB12AQ96EY5 273 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 SH3GL1Q99961 368 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 THTPAQ9BU02 230 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 EDEM2Q9BV94 578 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 FANCEQ9HB96 536 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 TMEM9BQ9NQ34 198 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 TMEM9Q9P0T7 183 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 FTSJ1Q9UET6 329 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 SPACA6W5XKT8 324 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 ASXL3Q9C0F0 2248 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 ADAMTS20P59510 1910 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 RP1P56715 2156 aa11.84□□□□□ -0.51
CFDP1-201ENST00000283882 A0A0G2JN53 185 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 BLACEA4D250 179 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 D6RAR5 112 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 RFXANKO14593 260 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 PROM1O43490 865 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 HCRTR1O43613 425 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 CIB2O75838 187 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 NSA2O95478 260 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 AIFM1O95831 613 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 STATHP02808 62 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 NR2F6P10588 404 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 CD59P13987 128 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 HSD17B1P14061 328 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 PPIBP23284 216 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 SLC7A2P52569 658 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 ACY1Q03154 408 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 ILKQ13418 452 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 MLC1Q15049 377 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 MUM1Q2TAK8 710 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 DEFB134Q4QY38 66 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 ZNF385BQ569K4 471 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 C6orf10Q5SRN2 563 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 TLDC1Q6P9B6 456 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 CYB5D1Q6P9G0 228 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 USP53Q70EK8 1073 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 SLITRK4Q8IW52 837 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 KIAA2013Q8IYS2 634 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 AMER3Q8N944 861 aa11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
CFDP1-201ENST00000283882 TMEM125Q96AQ2 219 aa11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms