RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260054.8

CCDC90B-201, Transcript of coiled-coil domain containing 90B, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC90B, Length 1,688 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90B-201ENST00000260054 WASF3Q9UPY6 502 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 ATG4BQ9Y4P1 393 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 GPR45Q9Y5Y3 372 aa14.94□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 CHST10O43529 356 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 DLGAP3O95886 979 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 SPINK2P20155 84 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 TAS2R50P59544 299 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 ZSCAN26Q16670 478 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 LCN10Q6JVE6 187 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 COX15Q7KZN9 410 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 GPR180Q86V85 440 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 PARP9Q8IXQ6 854 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 DSELQ8IZU8 1212 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 MMP21Q8N119 569 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 CDC26Q8NHZ8 85 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 COL26A1Q96A83 441 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 BRINP2Q9C0B6 783 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 NRSN2Q9GZP1 204 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 ACTL8Q9H568 366 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 LYRM4Q9HD34 91 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 A0A1W2PR48 441 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 CDRT15L2A8MXV6 281 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 ANKRD28O15084 1053 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 NVLO15381 856 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 IL3P08700 152 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 IDO1P14902 403 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 FBLP22087 321 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 SLC5A2P31639 672 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 DCDP81605 110 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 SHC2P98077 582 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 GSTA3Q16772 222 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 ARHGAP40Q5TG30 622 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 C18orf63Q68DL7 685 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 GALNT6Q8NCL4 622 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 OR51Q1Q8NH59 317 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 CSF3RQ99062 836 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 B3GNT4Q9C0J1 378 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 ZNF385DQ9H6B1 395 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 MYNNQ9NPC7 610 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 ASCL3Q9NQ33 180 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 TRIM33Q9UPN9 1127 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa14.93□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 PROM1O43490 865 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 LRATO95237 230 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 AIFM1O95831 613 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 ONECUT2O95948 504 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 NME5P56597 212 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 RAB38P57729 211 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 MC1RQ01726 317 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 FAM71E1Q6IPT2 247 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 IGF2-ASQ6U949 168 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 FAM47BQ8NA70 645 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 NUDT8Q8WV74 236 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 UCN3Q969E3 161 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 PEX11GQ96HA9 241 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 TEX37Q96LM6 180 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 SCNM1Q9BWG6 230 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 RBCK1Q9BYM8 510 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 NMUR2Q9GZQ4 415 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 PHF11Q9UIL8 331 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 SDK2Q58EX2 2172 aa14.92□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 FAM227AF5H4B4 570 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 CYR61O00622 381 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 AKAP10O43572 662 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 RNH1P13489 461 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 CPN2P22792 545 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 XCR1P46094 333 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 GSTM5P46439 218 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 ASMTP46597 345 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 CLDN8P56748 225 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 UFM1P61960 85 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 TNFRSF17Q02223 184 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 KLC1Q07866 573 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 RTP5Q14D33 572 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 RPS6KA2Q15349 733 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC90B-201ENST00000260054 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms