RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252487.9

TOMM40-201, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,707 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-201ENST00000252487 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 PISDQ9UG56 409 aa24.68■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 A0A088AWK7 358 aa24.67■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 KCNK5O95279 499 aa24.67■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 NSA2O95478 260 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 AIFM1O95831 613 aa24.67■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 FGF5P12034 268 aa24.67■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 ITGAXP20702 1163 aa24.67■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 ASMTP46597 345 aa24.67■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 CPA2P48052 419 aa24.67■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 KLC1Q07866 573 aa24.67■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 SPANXN4Q5MJ08 99 aa24.67■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 GPR180Q86V85 440 aa24.67■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 FAM47BQ8NA70 645 aa24.67■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 VPS33AQ96AX1 596 aa24.67■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 DAPP1Q9UN19 280 aa24.67■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 EBAG9O00559 213 aa24.66■■□□□ 1.54
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TOMM40-201ENST00000252487 ZNF28P17035 718 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 CAPN3P20807 821 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 EMP3P54852 163 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 SHC2P98077 582 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 PGS1Q32NB8 556 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 TIGD2Q4W5G0 525 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa24.66■■□□□ 1.54
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TOMM40-201ENST00000252487 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 FAM227AF5H4B4 570 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 DSCR3O14972 297 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 CHST10O43529 356 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 CDK4P11802 303 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 COX4I1P13073 169 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 COX7A2P14406 83 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 AVPR1BP47901 424 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 IL11RAQ14626 422 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 SPRED3Q2MJR0 410 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 VPS26BQ4G0F5 336 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 ZNF385BQ569K4 471 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 C3orf38Q5JPI3 329 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 ZBTB18Q99592 522 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 FBXO8Q9NRD0 319 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 TXLNGQ9NUQ3 528 aa24.66■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 FAM234BA2RU67 622 aa24.65■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 DCDC2BA2VCK2 349 aa24.65■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 GABRR3A8MPY1 467 aa24.65■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 B4E171 279 aa24.65■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 PROM1O43490 865 aa24.65■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 FURINP09958 794 aa24.65■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 PRPS1L1P21108 318 aa24.65■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 HPCAL1P37235 193 aa24.65■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 TSPAN7P41732 249 aa24.65■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 TMEM52Q8NDY8 209 aa24.65■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 CLIP3Q96DZ5 547 aa24.65■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 REEP4Q9H6H4 257 aa24.65■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 PTPRBP23467 1997 aa24.65■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 A0A1B0GX78 115 aa24.64■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 PGRMC2O15173 223 aa24.64■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 SLC22A2O15244 555 aa24.64■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 LAMP1P11279 417 aa24.64■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 CPN2P22792 545 aa24.64■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
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TOMM40-201ENST00000252487 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
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TOMM40-201ENST00000252487 IKBIPQ70UQ0 350 aa24.64■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 TICAM1Q8IUC6 712 aa24.64■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 PEX11GQ96HA9 241 aa24.64■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 SLC52A3Q9NQ40 469 aa24.64■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 DLL3Q9NYJ7 618 aa24.64■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 SRPK3Q9UPE1 567 aa24.64■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 SATB2Q9UPW6 733 aa24.64■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa24.64■■□□□ 1.54
TOMM40-201ENST00000252487 CCDC187A0A096LP49 1063 aa24.64■■□□□ 1.53
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TOMM40-201ENST00000252487 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
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TOMM40-201ENST00000252487 T-ENOLP0DO92 83 aa24.64■■□□□ 1.53
TOMM40-201ENST00000252487 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
TOMM40-201ENST00000252487 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
TOMM40-201ENST00000252487 KCNK10P57789 538 aa24.64■■□□□ 1.53
TOMM40-201ENST00000252487 PHC1P78364 1004 aa24.64■■□□□ 1.53
TOMM40-201ENST00000252487 TNFRSF17Q02223 184 aa24.64■■□□□ 1.53
TOMM40-201ENST00000252487 RHBDD2Q6NTF9 364 aa24.64■■□□□ 1.53
TOMM40-201ENST00000252487 FAM9CQ8IZT9 166 aa24.64■■□□□ 1.53
TOMM40-201ENST00000252487 SPDL1Q96EA4 605 aa24.64■■□□□ 1.53
TOMM40-201ENST00000252487 LYRM4Q9HD34 91 aa24.64■■□□□ 1.53
TOMM40-201ENST00000252487 MIEF1Q9NQG6 463 aa24.64■■□□□ 1.53
TOMM40-201ENST00000252487 SH3BP4Q9P0V3 963 aa24.64■■□□□ 1.53
TOMM40-201ENST00000252487 ERICH4A6NGS2 130 aa24.63■■□□□ 1.53
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