RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 MSRB3Q8IXL7 192 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 UBTD2Q8WUN7 234 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35B4Q969S0 331 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 NCLNQ969V3 563 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 C19orf43Q9BQ61 176 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM168Q9H0V1 697 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 RMND5AQ9H871 391 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM247A6NEH6 219 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 JRKO75564 520 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.628e-7■■■■□ 23
CAPNS1-201ENST00000246533 IGFBP5P24593 272 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 CSNK2BP67870 215 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC35A2P78381 396 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 IL5RAQ01344 420 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 VAC14Q08AM6 782 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ADCK1Q86TW2 530 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 LACC1Q8IV20 430 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 MFSD4AQ8N468 514 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB124Q8NES8 71 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 LMX1AQ8TE12 382 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 BTN2A2Q8WVV5 523 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 GLYATL1Q969I3 302 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC29A3Q9BZD2 475 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 DLL3Q9NYJ7 618 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 AQP9O43315 295 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 PRAMEF1O95521 474 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 MYF5P13349 255 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 PIK3CGP48736 1102 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.622e-14■■□□□ 13.1
CAPNS1-201ENST00000246533 FADDQ13158 208 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 OXR1Q8N573 874 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 EID2Q8N6I1 236 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 NTMT1Q9BV86 223 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ISPDA4D126 451 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 HTR3EA5X5Y0 456 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ULK1O75385 1050 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 RASGRP1O95267 797 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 NADKO95544 446 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 EBLN1P0CF75 366 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ABHD18Q0P651 414 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC14A1Q13336 389 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 PIP4P1Q86T03 277 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 NAXDQ8IW45 347 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 SFTPA2Q8IWL1 248 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 OR52E6Q96RD3 313 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 LRTM1Q9HBL6 345 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 GZMMP51124 257 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 INAQ16352 499 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 LDLRAP1Q5SW96 308 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 CPZQ66K79 652 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 TUBA3EQ6PEY2 450 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB46Q86UZ6 589 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 HS3ST5Q8IZT8 346 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 LIX1Q8N485 282 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 RHBDD1Q8TEB9 315 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ITCHQ96J02 903 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2AG1Q9H205 316 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa25.17■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 KDM1AO60341 852 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 CCNDBP1O95273 360 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINA1P01009 418 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 CD40LGP29965 261 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 LAPTM5Q13571 262 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 PTGR1Q14914 329 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 NPTX1Q15818 432 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB133Q30KQ1 61 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 SPANXN4Q5MJ08 99 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 TAS2R42Q7RTR8 314 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 GLMNQ92990 594 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ASB8Q9H765 288 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 RAD18Q9NS91 495 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 OPTCQ9UBM4 332 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CAPNS1-201ENST00000246533 KELP23276 732 aa25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms