RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243077.7

LRP1-201, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP1, Length 14,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-201ENST00000243077 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.029e-7■■■■■ 30.5
LRP1-201ENST00000243077 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 BEST3Q8N1M1 668 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 G6PDP11413 515 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 GTF2F2P13984 249 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 PRKCDQ05655 676 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 BCL2A1Q16548 175 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 SIRPB2Q5JXA9 342 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 MPP7Q5T2T1 576 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 JAGN1Q8N5M9 183 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 NINJ1Q92982 152 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 SLC5A7Q9GZV3 580 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 GHRLQ9UBU3 117 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 HES2Q9Y543 173 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 THBS2P35442 1172 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 RNH1P13489 461 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 DLSTP36957 453 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 PXKQ7Z7A4 578 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 SAMD11Q96NU1 681 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 RAD51DO75771 328 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 NCK1P16333 377 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 TM4SF1P30408 202 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 FRKP42685 505 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 MOGSQ13724 837 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 KEAP1Q14145 624 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 C14orf80Q86SX3 495 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 THAP4Q8WY91 577 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 NT5DC2Q9H857 520 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 POU2F1P14859 743 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 NOXRED1Q6NXP6 359 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 CERS5Q8N5B7 392 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 OR5J2Q8NH18 312 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 EBPLQ9BY08 206 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 HEBP1Q9NRV9 189 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 NPRL3Q12980 569 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 SLC18B1Q6NT16 456 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 ARSKQ6UWY0 536 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 OR5L2Q8NGL0 311 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 RNF128Q8TEB7 428 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 CHIAQ9BZP6 476 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 SLC22A14Q9Y267 594 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.7□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 UFM1P61960 85 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 RPS21P63220 83 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 HSD3B7Q9H2F3 369 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 M0R2N6 131 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 SHMT2P34897 504 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 RGS19P49795 217 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 NCS1P62166 190 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 TGFBIQ15582 683 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 SLC8B1Q6J4K2 584 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 RGMBQ6NW40 437 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 GLTPQ9NZD2 209 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 DHDHQ9UQ10 334 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 TRIM64CA6NLI5 447 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 PSPHP78330 225 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 MINDY4Q4G0A6 757 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 SHFQ7M4L6 423 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 GKN2Q86XP6 184 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 MFSD8Q8NHS3 518 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 TMEM174Q8WUU8 243 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 NKD1Q969G9 470 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 ARL11Q969Q4 196 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 TSSK6Q9BXA6 273 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 A0A0U1RQF3 1178 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 CLUP10909 449 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 PARP8Q8N3A8 854 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 TEX26Q8N6G2 289 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 GPATCH2Q9NW75 528 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 RPA4Q13156 261 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 ZFAND4Q86XD8 727 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 GON7Q9BXV9 100 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 GALPQ9UBC7 116 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 PCM1Q15154 2024 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 PIAS1O75925 651 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 GSRP00390 522 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 PGDP52209 483 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 IQCHQ86VS3 1027 aa8.69□□□□□ -1.02
LRP1-201ENST00000243077 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms