RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 LYRM4Q9HD34 91 aa20.95■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 SENP1Q9P0U3 644 aa20.95■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 MANBAO00462 879 aa20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 EEDO75530 441 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 ESRRBO95718 433 aa20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 JAK1P23458 1154 aa20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 ALDH3A1P30838 453 aa20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 TSFMP43897 325 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 FOXA1P55317 472 aa20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 PKNOX1P55347 436 aa20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 IFT88Q13099 833 aa20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 RAPSNQ13702 412 aa20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 MYBPC3Q14896 1274 aa20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 NSDHLQ15738 373 aa20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 SGO1Q5FBB7 561 aa20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 METTL21AQ8WXB1 218 aa20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 PTCHD1Q96NR3 888 aa20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 KCNA7Q96RP8 456 aa20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 SERPINI1Q99574 410 aa20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 MECRQ9BV79 373 aa20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 SPTA1P02549 2419 aa20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 A0A0A6YYD5 115 aa20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 PRMT3O60678 531 aa20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 TRIM13O60858 407 aa20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 CELA2AP08217 269 aa20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 MAOAP21397 527 aa20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 SSR2P43308 183 aa20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 HTR6P50406 440 aa20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 PHEXP78562 749 aa20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 MPP2Q14168 576 aa20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 ATG14Q6ZNE5 492 aa20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 FAM47BQ8NA70 645 aa20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 SELENOMQ8WWX9 145 aa20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 PSMF1Q92530 271 aa20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 VPS50Q96JG6 964 aa20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 SLC29A3Q9BZD2 475 aa20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 ELOVL6Q9H5J4 265 aa20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 MID1IP1Q9NPA3 183 aa20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 PRDM9Q9NQV7 894 aa20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 MID2Q9UJV3 735 aa20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 SNX6Q9UNH7 406 aa20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 TIMM22Q9Y584 194 aa20.93■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa20.92■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 TMPRSS11DO60235 418 aa20.92■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 SEMA3DO95025 777 aa20.92■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 CHN1P15882 459 aa20.92■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 NAA20P61599 178 aa20.92■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 SLAMF1Q13291 335 aa20.92■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 OR6Y1Q8NGX8 325 aa20.92■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 METTL6Q8TCB7 284 aa20.92■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 HBEGFQ99075 208 aa20.92■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 TUBB6Q9BUF5 446 aa20.92■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 GPR83Q9NYM4 423 aa20.92■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 STK38LQ9Y2H1 464 aa20.92■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 MMACHCQ9Y4U1 282 aa20.92■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 ASB4Q9Y574 426 aa20.92■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 PRR35P0CG20 571 aa20.91■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 RAP1GDS1P52306 607 aa20.91■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 HSD17B7P56937 341 aa20.91■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 NFATC3Q12968 1075 aa20.91■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 SFT2D3Q587I9 215 aa20.91■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 ASB18Q6ZVZ8 466 aa20.91■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 METTL4Q8N3J2 472 aa20.91■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa20.91■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 BRF2Q9HAW0 419 aa20.91■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 RIC8BQ9NVN3 520 aa20.91■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 FBXW2Q9UKT8 454 aa20.91■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 ATG4BQ9Y4P1 393 aa20.91■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 SERTM1A2A2V5 107 aa20.9■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 SERPINA7P05543 415 aa20.9■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 ENO1P06733 434 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 ITGA3P26006 1051 aa20.9■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 ARRB2P32121 409 aa20.9■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 CROCCP2Q86T23 111 aa20.9■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 ZNF595Q8IYB9 648 aa20.9■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 UCN3Q969E3 161 aa20.9■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
SYF2-201ENST00000236273 CENPKQ9BS16 269 aa20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms