RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF750Q32MQ0 723 aa15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 CHRFAM7AQ494W8 412 aa15.13■□□□□ 0.01
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SPCS1-201ENST00000233025 MEI1Q5TIA1 1274 aa15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ADGRD1Q6QNK2 874 aa15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 C20orf204Q6ZNR8 217 aa15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 SLC26A11Q86WA9 606 aa15.13■□□□□ 0.01
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SPCS1-201ENST00000233025 THAP11Q96EK4 314 aa15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 VMP1Q96GC9 406 aa15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 SCYL1Q96KG9 808 aa15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 RASL10BQ96S79 203 aa15.13■□□□□ 0.01
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SPCS1-201ENST00000233025 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 NECTIN3Q9NQS3 549 aa15.13■□□□□ 0.01
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SPCS1-201ENST00000233025 CATSPERZQ9NTU4 200 aa15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM184CQ9NVA4 438 aa15.13■□□□□ 0.01
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SPCS1-201ENST00000233025 ZNF148Q9UQR1 794 aa15.13■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa15.13■□□□□ 0.01
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SPCS1-201ENST00000233025 KPNA5O15131 536 aa15.12■□□□□ 0.01
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SPCS1-201ENST00000233025 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
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SPCS1-201ENST00000233025 ATP5DP30049 168 aa15.12■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 HSD17B2P37059 387 aa15.12■□□□□ 0.01
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SPCS1-201ENST00000233025 HERC3Q15034 1050 aa15.12■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
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SPCS1-201ENST00000233025 FAM47EQ6ZV65 393 aa15.12■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ASPGQ86U10 573 aa15.12■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 MEIOBQ8N635 442 aa15.12■□□□□ 0.01
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SPCS1-201ENST00000233025 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
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SPCS1-201ENST00000233025 SLC6A15Q9H2J7 730 aa15.12■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 CHRAC1Q9NRG0 131 aa15.12■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ABCF3Q9NUQ8 709 aa15.12■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 PAK5Q9P286 719 aa15.12■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ATG4BQ9Y4P1 393 aa15.12■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF839A8K0R7 811 aa15.11■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 CD5LO43866 347 aa15.11■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 IL18BPO95998 194 aa15.11■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 CTSSP25774 331 aa15.11■□□□□ 0.01
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SPCS1-201ENST00000233025 PRDM9Q9NQV7 894 aa15.11■□□□□ 0.01
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SPCS1-201ENST00000233025 MYOTQ9UBF9 498 aa15.11■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 GUCA1BQ9UMX6 200 aa15.11■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
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SPCS1-201ENST00000233025 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ZFAND5O76080 213 aa15.1■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 B3GALT4O96024 378 aa15.1■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 RFPL3SP0C7P2 107 aa15.1■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 CCL3P10147 92 aa15.1■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP15.1■□□□□ 0.017e-6■□□□□ 8.7
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SPCS1-201ENST00000233025 TTPAP49638 278 aa15.1■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 NR1H2P55055 460 aa15.1■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ADARP55265 1226 aaKnown RBP15.1■□□□□ 0.01
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SPCS1-201ENST00000233025 DEFB134Q4QY38 66 aa15.1■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 CTSL3PQ5NE16 218 aa15.1■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa15.1■□□□□ 0.01
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SPCS1-201ENST00000233025 MPP5Q8N3R9 675 aa15.1■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 SLC13A3Q8WWT9 602 aa15.1■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 NTNG2Q96CW9 530 aa15.1■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC77Q9BR77 488 aa15.1■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 TSGA10Q9BZW7 698 aa15.1■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 ACKR4Q9NPB9 350 aa15.1■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 FAM114A2Q9NRY5 505 aa15.1■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 SH2B3Q9UQQ2 575 aa15.1■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 RNF223E7ERA6 249 aa15.09■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 WWP2O00308 870 aa15.09■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 CTIFO43310 598 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 SLC35G6P0C7Q6 338 aa15.09■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 HRH2P25021 359 aa15.09■□□□□ 0.01
SPCS1-201ENST00000233025 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
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