RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 A0A1W2PQ09 198 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 IRF1P10914 325 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 CD22P20273 847 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 HLA-DMAP28067 261 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 C19orf57Q0VDD7 668 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 E2F2Q14209 437 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 TIGD3Q6B0B8 471 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 KLHL17Q6TDP4 642 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 ELMO1Q92556 727 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 MSLNLQ96KJ4 702 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 BBS2Q9BXC9 721 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 TBX21Q9UL17 535 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 SSR3Q9UNL2 185 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 ADAP00813 363 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 SERPINA4P29622 427 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 RPL3P39023 403 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 CSKP41240 450 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 PNLIPRP1P54315 467 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 DUSP7Q16829 419 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 SYCE2Q6PIF2 218 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC39A11Q8N1S5 342 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 PROKR2Q8NFJ6 384 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 VWCEQ96DN2 955 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 VPS35Q96QK1 796 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 ABCB8Q9NUT2 735 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 TMEM39AQ9NV64 488 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 GPATCH2Q9NW75 528 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 KLHL20Q9Y2M5 609 aa21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 PRAMEF25A6NGN4 478 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 PCDH17O14917 1159 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 OPN1SWP03999 348 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 ADRA2AP08913 450 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 CNR2P34972 360 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 OR1E2P47887 323 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 RACK1P63244 317 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 VEPH1Q14D04 833 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 HSDL2Q6YN16 418 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF438Q7Z4V0 828 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 LAX1Q8IWV1 398 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 PEX5LQ8IYB4 626 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 TCTE3Q8IZS6 198 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 RNF175Q8N4F7 328 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 AQP11Q8NBQ7 271 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 ANGPTL6Q8NI99 470 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC25A46Q96AG3 418 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 C1GALT1Q9NS00 363 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 KCND3Q9UK17 655 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 PPIL1Q9Y3C6 166 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 C2orf78A6NCI8 922 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 IGSF6O95976 241 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 ETFAP13804 333 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 ERP29P30040 261 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 ZXDBP98169 803 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 TP53BP2Q13625 1128 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 C1DQ13901 141 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 DOC2AQ14183 400 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 CRTC1Q6UUV9 634 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 LAS2Q8IYD9 372 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 TTC9Q92623 222 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 FRMD6Q96NE9 622 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 KLHL21Q9UJP4 597 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 ANGPT4Q9Y264 503 aa21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 CSO75390 466 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 TNFRSF1BP20333 461 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 CDK6Q00534 326 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 SLAMF1Q13291 335 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 ILKQ13418 452 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 CDH18Q13634 790 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 PPP2R2DQ66LE6 453 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC149Q6ZUS6 474 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 ASIC4Q96FT7 647 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 DMRTB1Q96MA1 342 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 SLC35A5Q9BS91 424 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 ACOXLQ9NUZ1 547 aa21.83■■□□□ 1.09
ANKRD54-201ENST00000215941 TLR4O00206 839 aa21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54-201ENST00000215941 PRRG1O14668 218 aa21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54-201ENST00000215941 NANOGP1Q8N7R0 232 aa21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54-201ENST00000215941 OR6K2Q8NGY2 324 aa21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54-201ENST00000215941 NFKBIDQ8NI38 313 aa21.82■■□□□ 1.08
ANKRD54-201ENST00000215941 SCRN2Q96FV2 425 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms