RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000060847.5

Ssu2-201, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ssu2, Length 1,321 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Hspa14Q99M31 509 aa14.6□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Q9CQM1 111 aa14.6□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Vkorc1Q9CRC0 161 aa14.6□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 MINDY3Q9CV28 444 aa14.6□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 MtpapQ9D0D3 585 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Pgm1Q9D0F9 562 aa14.6□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Erv3Q9DAX3 200 aa14.6□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 CalyQ9DCA7 226 aa14.6□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Rcan2Q9JHG2 197 aa14.6□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Tcf23Q9JLR5 209 aa14.6□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Zbp1Q9QY24 411 aa14.6□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Bmp10Q9R229 421 aa14.6□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Skp1Q9WTX5 163 aa14.6□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Srpk3Q9Z0G2 565 aa14.6□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Clic1Q9Z1Q5 241 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 VarsQ9Z1Q9 1263 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Cldn8Q9Z260 225 aa14.6□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 AcacbE9Q4Z2 2448 aa14.6□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Cnot1Q6ZQ08 2375 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Cd163l1A0A1B0GSB0 991 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Tnfrsf25B1AWN9 411 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Gm15155B1B034 138 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Zfp964B2RR88 472 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Gm2832F7AEC7 200 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Olfr237-ps1K9J725 310 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Tcn2O88968 430 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Egr1P08046 533 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 GzmgP13366 248 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Il1rl1P14719 567 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Rpl3P27659 403 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 BrafP28028 804 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Hoxc11P31313 304 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Slc1a5P51912 553 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Atp6v1b2P62814 511 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Tra2bP62996 288 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Tbx6P70327 436 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 IgfalsP70389 603 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Zfp935Q14DI0 353 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 HexdcQ3U4H6 486 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Mapkapk3Q3UMW7 384 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Ddx5Q61656 614 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Doxl2Q6IMK7 723 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Sephs1Q8BH69 392 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Pp2d1Q8BVT6 620 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Larp4Q8BWW4 719 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Stx5Q8K1E0 355 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Clec2fQ8VI21 196 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Vps11Q91W86 941 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Gjd3Q91YD1 278 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Ptgr1Q91YR9 329 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Scd3Q99PL7 359 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Lypd2Q9DD23 127 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Hcar2Q9EP66 360 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 B3galt5Q9JI67 308 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Slamf1Q9QUM4 343 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Morf4l2Q9R0Q4 288 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Gdf2Q9WV56 428 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Ybx2Q9Z2C8 360 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Sdk2Q6V4S5 2176 aa14.59□□□□□ -0.07
Ssu2-201ENSMUST00000060847 AgrnA2ASQ1 1950 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Gm21731A0A286YDE9 180 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Vmn1r3A2AMT7 306 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Gm20721E9Q2U8 318 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Gm7535F7CXE4 302 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Ppt2O35448 302 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Cxcl10P17515 98 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Entpd1P55772 510 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Ufm1P61961 85 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Acss3Q14DH7 682 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Ankdd1bQ14DN9 521 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 CiartQ3TQ03 375 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Togaram2Q3TYG6 1002 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Vwa5b2Q3UR50 1248 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Tex10Q3URQ0 928 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Bcl2a1bQ497M6 172 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Kctd8Q50H33 476 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Chsy3Q5DTK1 884 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Hspa1aQ61696 641 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Arl15Q8BGR6 204 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Rnf38Q8BI21 518 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Rcn2Q8BP92 320 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Cpne3Q8BT60 533 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Bbs4Q8C1Z7 520 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Polr1eQ8K202 482 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Trim31Q8R0K2 507 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Vmn1r79Q8R285 306 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Myoz3Q8R4E4 245 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Lipt1Q8VCM4 373 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Olfr582Q8VGV9 319 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Snrpb2Q9CQI7 225 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Khdc3Q9CWU5 440 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Utp11Q9CZJ1 253 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Yae1d1Q9DAY6 216 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Dbf4Q9QZ41 663 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Dlc1Q9R0Z9 1092 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Uba2Q9Z1F9 638 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Zfhx4Q9JJN2 3550 aa14.58□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Smok3cA0A087WSF2 504 aa14.57□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Gm5141A0A0J9YUW3 581 aa14.57□□□□□ -0.08
Ssu2-201ENSMUST00000060847 Vmn2r97K7N6Z2 861 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.1 ms